RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 GNASQ5JWF2 1037 aa22.03■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 RNF180Q86T96 592 aa22.03■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 PPTC7Q8NI37 304 aa22.03■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.03■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 ELP1O95163 1332 aa22.03■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 CCNE2O96020 404 aa22.02■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 ME1P48163 572 aa22.02■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 ACTR2P61160 394 aa22.02■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.02■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 GPR20Q99678 358 aa22.02■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 SAMM50Q9Y512 469 aa22.02■■□□□ 1.12
SNHG12-201ENST00000461448 A6NJR5 290 aa22.02■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 CTAGE5O15320 804 aa22.02■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 TECP42680 631 aa22.02■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 PDIA5Q14554 519 aa22.02■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 LRRC41Q15345 812 aa22.02■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 TNS4Q8IZW8 715 aa22.02■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.02■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 VAV3Q9UKW4 847 aa22.02■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.02■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 STK24Q9Y6E0 443 aa22.02■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 ZEB2O60315 1214 aa22.01■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 MMP3P08254 477 aa22.01■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 GJA8P48165 433 aa22.01■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
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SNHG12-201ENST00000461448 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.01■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.01■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 ABHD8Q96I13 439 aa22.01■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 CUTAO60888 179 aa22■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 MYL3P08590 195 aa22■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 NKX3-2P78367 333 aa22■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 PPP2R5CQ13362 524 aa22■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 DGKDQ16760 1214 aa22■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 AK8Q96MA6 479 aa22■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 DISC1Q9NRI5 854 aa22■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 TCHHQ07283 1943 aa21.99■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 VWA3AA6NCI4 1184 aa21.99■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 WDR64B1ANS9 1081 aa21.99■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 PPFIA4O75335 1185 aa21.99■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 JAK3P52333 1124 aa21.99■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 KCNA10Q16322 511 aa21.99■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 IL17AQ16552 155 aa21.99■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 TMEM87AQ8NBN3 555 aa21.99■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 GDPD2Q9HCC8 539 aa21.99■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.99■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 KBTBD13C9JR72 458 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 EML1O00423 815 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 SFNP31947 248 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 SPIRE1Q08AE8 756 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 POTEMA6NI47 508 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 BACH1O14867 736 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 ATG7O95352 703 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 PSAPP07602 524 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 ADALQ6DHV7 355 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 ERMNQ8TAM6 284 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 LRWD1Q9UFC0 647 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 CENPFP49454 3210 aa21.97■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 KPNA6O60684 536 aa21.97■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 ASGR1P07306 291 aa21.97■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 SWSAP1Q6NVH7 229 aa21.97■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 RDM1Q8NG50 284 aa21.97■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 DNM1LO00429 736 aa21.96■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 LGALS2P05162 132 aa21.96■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF286BP0CG31 522 aa21.96■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 EPHA7Q15375 998 aa21.96■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.96■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 GLG1Q92896 1179 aa21.96■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 AZI2Q9H6S1 392 aa21.96■■□□□ 1.11
SNHG12-201ENST00000461448 TXLNAP40222 546 aa21.95■■□□□ 1.1
SNHG12-201ENST00000461448 ACLYP53396 1101 aa21.95■■□□□ 1.1
SNHG12-201ENST00000461448 CHMP4BP1P59074 171 aa21.95■■□□□ 1.1
SNHG12-201ENST00000461448 GRIN1Q05586 938 aa21.95■■□□□ 1.1
SNHG12-201ENST00000461448 FAM160B1Q5W0V3 765 aa21.95■■□□□ 1.1
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