RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 CRYGNQ8WXF5 182 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 VWCEQ96DN2 955 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 TPCN1Q9ULQ1 816 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 PFKFB2O60825 505 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 SEC24BO95487 1268 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 SCRN1Q12765 414 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 HIC1Q14526 733 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 LRRC8DQ7L1W4 858 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 SERINC5Q86VE9 423 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 GLG1Q92896 1179 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa26.18■■□□□ 1.78
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PTPN4-208ENST00000460289 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM265A0A087WTH1 108 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 FAM86B1E9PN63 330 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 FAM86B2P0C5J1 330 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 AK2P54819 239 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 PLA2G4DQ86XP0 818 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 DOCK5Q9H7D0 1870 aa26.17■■□□□ 1.78
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PTPN4-208ENST00000460289 ZBBXA8MT70 800 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 ADAMTS3O15072 1205 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 GALNT17Q6IS24 598 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 SEMA6BQ9H3T3 888 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 AZI2Q9H6S1 392 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 SETD4Q9NVD3 440 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 PCDHA4Q9UN74 947 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 NEK4P51957 841 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 SETQ01105 290 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
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PTPN4-208ENST00000460289 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 FAM161BQ96MY7 647 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 EMSYQ7Z589 1322 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 TREHO43280 583 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 DNAJB2P25686 324 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 CIITAP33076 1130 aa26.14■■□□□ 1.78
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PTPN4-208ENST00000460289 USP11P51784 963 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 ACTR2P61160 394 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF618Q5T7W0 954 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPN4-208ENST00000460289 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PTPN4-208ENST00000460289 GRXCR1A8MXD5 290 aa26.13■■□□□ 1.77
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PTPN4-208ENST00000460289 RAB30Q15771 203 aa26.13■■□□□ 1.77
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PTPN4-208ENST00000460289 ADAM17P78536 824 aa26.12■■□□□ 1.77
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PTPN4-208ENST00000460289 RSPH10BP0C881 870 aa26.11■■□□□ 1.77
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PTPN4-208ENST00000460289 STAT5BP51692 787 aa26.11■■□□□ 1.77
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PTPN4-208ENST00000460289 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
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PTPN4-208ENST00000460289 TAF2Q6P1X5 1199 aa26.09■■□□□ 1.77
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PTPN4-208ENST00000460289 ZNF576Q9H609 170 aa26.09■■□□□ 1.77
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