RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 BOLA2Q9H3K6 86 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 IL21Q9HBE4 155 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 USTQ9Y2C2 406 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 RAB11FIP3O75154 756 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 LGR5O75473 907 aa6.04□□□□□ -1.44
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CBX1-204ENST00000444685 ATP5JP18859 108 aa6.04□□□□□ -1.44
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CBX1-204ENST00000444685 SLC19A1P41440 591 aa6.04□□□□□ -1.44
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CBX1-204ENST00000444685 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
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CBX1-204ENST00000444685 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.04□□□□□ -1.44
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CBX1-204ENST00000444685 CHST3Q7LGC8 479 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 SPRED2Q7Z698 418 aa6.04□□□□□ -1.44
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CBX1-204ENST00000444685 FBXL6Q8N531 539 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 DNERQ8NFT8 737 aa6.04□□□□□ -1.44
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CBX1-204ENST00000444685 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 SEPT8Q92599 483 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 MTRQ99707 1265 aa6.04□□□□□ -1.44
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CBX1-204ENST00000444685 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 IGFLR1Q9H665 355 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 MAP10Q9P2G4 905 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 STX8Q9UNK0 236 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 NAV1Q8NEY1 1877 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 CFAP54Q96N23 3096 aa6.03□□□□□ -1.44
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CBX1-204ENST00000444685 RSPH10B2B2RC85 870 aa6.03□□□□□ -1.44
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CBX1-204ENST00000444685 RSPH10BP0C881 870 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 SKIP12755 728 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 GMPRP36959 345 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 THPOP40225 353 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 SNAP25P60880 206 aa6.03□□□□□ -1.44
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CBX1-204ENST00000444685 CCDC96Q2M329 555 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
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CBX1-204ENST00000444685 FIBCD1Q8N539 461 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 TET1Q8NFU7 2136 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 AFG1LQ8WV93 481 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 IL17RAQ96F46 866 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 ALG1Q9BT22 464 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 CD207Q9UJ71 328 aa6.03□□□□□ -1.44
CBX1-204ENST00000444685 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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CBX1-204ENST00000444685 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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CBX1-204ENST00000444685 NR1I2O75469 434 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 NDUFV1P49821 464 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 ZXDAP98168 799 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 KCNA1Q09470 495 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 LAMC2Q13753 1193 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 STXBP2Q15833 593 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.02□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 CEP85Q6P2H3 762 aa6.02□□□□□ -1.45
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