RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT12Q99456 494 aa20.14■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 EYA3Q99504 573 aa20.14■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 KLC4Q9NSK0 619 aa20.14■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.14■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 CHUKO15111 745 aa20.14■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 PALMO75781 387 aa20.14■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.14■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.14■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.14■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.14■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 SNED1Q8TER0 1413 aa20.14■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 E7EVH7 732 aa20.13■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 TRADDQ15628 312 aa20.13■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.13■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.13■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 RAD54LQ92698 747 aa20.13■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 POLLQ9UGP5 575 aa20.13■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 PLAAQ9Y263 795 aa20.13■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.13■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 RASSF9O75901 435 aa20.13■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 NOL4O94818 638 aa20.13■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.13■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 AKT1S1Q96B36 256 aa20.13■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 TMBIM4Q9HC24 238 aa20.13■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 EDIL3O43854 480 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 BAG3O95817 575 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK8P49336 464 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 NT5C2P49902 561 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 ARID5AQ03989 594 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 EHHADHQ08426 723 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 ECM1Q16610 540 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP85LQ5SZL2 805 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 COA7Q96BR5 231 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP95Q96GE4 821 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 USP17L5A8MUK1 530 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 KLRC1P26715 233 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 DRP2Q13474 957 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 GJA10Q969M2 543 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 GGA1Q9UJY5 639 aa20.12■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAF5O00463 557 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 TSG101Q99816 390 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 CD209Q9NNX6 404 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC40A1Q9NP59 571 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP72Q9P209 647 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 PSEN1P49768 467 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 TBC1D5Q92609 795 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 EDEM3Q9BZQ6 932 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 DONSONQ9NYP3 566 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 PLSCR1O15162 318 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 RAD51CO43502 376 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 SERPING1P05155 500 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT79Q5XKE5 535 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 BBOX1O75936 387 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 MYBP10242 640 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 COASYQ13057 564 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 NAB2Q15742 525 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 MSL1Q68DK7 614 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 LRIG3Q6UXM1 1119 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms