RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 TUFT1Q9NNX1 390 aa19.02■□□□□ 0.64
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDGFCQ9NRA1 345 aa19.02■□□□□ 0.64
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
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TOP3BP1-201ENST00000420768 GGPS1O95749 300 aa19.01■□□□□ 0.63
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KRBA2Q6ZNG9 492 aa18.99■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 CEP57L1Q8IYX8 460 aa18.99■□□□□ 0.63
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RAET1EQ8TD07 263 aa18.99■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ABHD15Q6UXT9 468 aa18.98■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 DYDC2Q96IM9 177 aa18.98■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 PNMA5Q96PV4 448 aa18.98■□□□□ 0.63
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TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM184BQ9ULE4 1060 aa18.98■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 HMGCRP04035 888 aa18.97■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa18.97■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYBAP13498 195 aa18.97■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMPD1P17405 629 aa18.97■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYP4A11Q02928 519 aa18.97■□□□□ 0.63
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATA33Q96N06 139 aa18.97■□□□□ 0.63
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM63CQ9P1W3 806 aa18.97■□□□□ 0.63
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TOP3BP1-201ENST00000420768 NOP56O00567 594 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 LYPLA2O95372 231 aa18.96■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 AKR1A1P14550 325 aa18.96■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 QARSP47897 775 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSMC5P62195 406 aa18.96■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 SP4Q02446 784 aa18.96■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGAP1Q07960 439 aa18.96■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAALADL2Q58DX5 795 aa18.96■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDXDC2PQ6P474 469 aa18.96■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 POTEBQ6S5H4 581 aa18.96■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 TPH2Q8IWU9 490 aa18.96■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLAIN1Q8ND83 568 aa18.96■□□□□ 0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP6V0A1Q93050 837 aa18.96■□□□□ 0.63
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TOP3BP1-201ENST00000420768 LXNQ9BS40 222 aa18.96■□□□□ 0.63
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