RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417171.5

PDZK1-202, Transcript of PDZ domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDZK1, Length 2,230 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1-202ENST00000417171 TMCC1O94876 653 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 UNC5CO95185 931 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 RPN1P04843 607 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 HAND2P61296 217 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 Q4G0T1 1027 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 SH2D4BQ5SQS7 431 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 STKLD1Q8NE28 680 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 OSBP2Q969R2 916 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 ZNF333Q96JL9 665 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 TSPAN18Q96SJ8 248 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 NEUROG2Q9H2A3 272 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 LRMDAQ9H2I8 198 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 OCEL1Q9H607 264 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 TMEM221A6NGB7 291 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 SIGLEC16A6NMB1 481 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 AGTP01019 485 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 OCRLQ01968 901 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 MAEAQ7L5Y9 396 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 PHC3Q8NDX5 983 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 ACTRT1Q8TDG2 376 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 TMEM165Q9HC07 324 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 TXLNGQ9NUQ3 528 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 PRKAG3Q9UGI9 489 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa9.6□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 LRP6O75581 1613 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 MAGEA13PA6NCF6 341 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 CCDC169A6NNP5 214 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 CCDC188H7C350 402 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 AKR1B10O60218 316 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 ECE2O60344 883 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 IGKV5-2P06315 115 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 FAM200BP0CF97 657 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 LIFRP42702 1097 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 LSAMPQ13449 338 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 GSTA3Q16772 222 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 RNF43Q68DV7 783 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 TTI2Q6NXR4 508 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 DYDC1Q8WWB3 177 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 UBAC1Q9BSL1 405 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 YIPF2Q9BWQ6 316 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 SHBGP04278 402 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 SKIP12755 728 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 YY1P25490 414 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 ACVR2BQ13705 512 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 ZNF365Q70YC5 407 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 MICU3Q86XE3 530 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 C2CD5Q86YS7 1000 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 SMYD1Q8NB12 490 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 INPP5DQ92835 1189 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 GATA6Q92908 595 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 GBP5Q96PP8 586 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 MTRQ99707 1265 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 SELENOSQ9BQE4 189 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 TMEM109Q9BVC6 243 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 EDEM3Q9BZQ6 932 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 GDAQ9Y2T3 454 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.59□□□□□ -0.87
PDZK1-202ENST00000417171 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PDZK1-202ENST00000417171 MYH6P13533 1939 aa9.58□□□□□ -0.88
PDZK1-202ENST00000417171 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa9.58□□□□□ -0.88
PDZK1-202ENST00000417171 TRIM49BA6NDI0 452 aa9.58□□□□□ -0.88
PDZK1-202ENST00000417171 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.58□□□□□ -0.88
PDZK1-202ENST00000417171 PSMA7O14818 248 aa9.58□□□□□ -0.88
PDZK1-202ENST00000417171 NVLO15381 856 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PDZK1-202ENST00000417171 PALMO75781 387 aa9.58□□□□□ -0.88
PDZK1-202ENST00000417171 TJP3O95049 919 aa9.58□□□□□ -0.88
PDZK1-202ENST00000417171 DEXIO95424 95 aa9.58□□□□□ -0.88
PDZK1-202ENST00000417171 FLT3P36888 993 aa9.58□□□□□ -0.88
PDZK1-202ENST00000417171 VHLP40337 213 aa9.58□□□□□ -0.88
PDZK1-202ENST00000417171 KLK7P49862 253 aa9.58□□□□□ -0.88
PDZK1-202ENST00000417171 CACNA2D1P54289 1103 aa9.58□□□□□ -0.88
PDZK1-202ENST00000417171 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PDZK1-202ENST00000417171 GCKRQ14397 625 aa9.58□□□□□ -0.88
PDZK1-202ENST00000417171 NAB2Q15742 525 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms