RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 SV2CQ496J9 727 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRK-209ENST00000415046 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 DIO2Q92813 273 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRK-209ENST00000415046 JAG2Q9Y219 1238 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRK-209ENST00000415046 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
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PTPRK-209ENST00000415046 FERMT3Q86UX7 667 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRK-209ENST00000415046 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 CCDC140Q96MF4 163 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRK-209ENST00000415046 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-209ENST00000415046 CAPNS1P04632 268 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-209ENST00000415046 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
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PTPRK-209ENST00000415046 ETFBP38117 255 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-209ENST00000415046 BCL6P41182 706 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-209ENST00000415046 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-209ENST00000415046 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
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PTPRK-209ENST00000415046 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.46□□□□□ -1.38
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PTPRK-209ENST00000415046 SYT3Q9BQG1 590 aa6.46□□□□□ -1.38
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PTPRK-209ENST00000415046 EFCAB6Q5THR3 1501 aa6.45□□□□□ -1.38
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PTPRK-209ENST00000415046 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRK-209ENST00000415046 PIK3C2BO00750 1634 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRK-209ENST00000415046 NAIPQ13075 1403 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRK-209ENST00000415046 UBR1Q8IWV7 1749 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRK-209ENST00000415046 GJB6O95452 261 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRK-209ENST00000415046 LCP1P13796 627 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRK-209ENST00000415046 STAT5AP42229 794 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRK-209ENST00000415046 KCNJ6P48051 423 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRK-209ENST00000415046 LSAMPQ13449 338 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRK-209ENST00000415046 CHRNA2Q15822 529 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRK-209ENST00000415046 CR1LQ2VPA4 569 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRK-209ENST00000415046 EMC4Q5J8M3 183 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRK-209ENST00000415046 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRK-209ENST00000415046 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRK-209ENST00000415046 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.43□□□□□ -1.38
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