RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412845.1

NEFHP1-201, Transcript of neurofilament heavy pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene NEFHP1, Length 2,629 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP1-201ENST00000412845 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.62■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 ACTN1P12814 892 aa20.62■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 USP8P40818 1118 aa20.62■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 PDIA5Q14554 519 aa20.62■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 RPS6KA1Q15418 735 aa20.62■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.62■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC91Q7Z6B0 441 aa20.62■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.62■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.62■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 ESYT2A0FGR8 921 aa20.62■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 FLT3P36888 993 aa20.62■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 PTK2Q05397 1052 aa20.62■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 ASIC2Q16515 512 aa20.62■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 TAF4BQ92750 862 aa20.62■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 CEP104O60308 925 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 KIF4AO95239 1232 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 TNNI2P48788 182 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 NT5C2P49902 561 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 RAB34Q9BZG1 259 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 BACH1O14867 736 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 TMOD1P28289 359 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 ADCY7P51828 1080 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF844Q08AG5 666 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 UBE2SQ16763 222 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 SCFD2Q8WU76 684 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 HAS1Q92839 578 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 NLRP3Q96P20 1036 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 VCPKMTQ9H867 229 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.61■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 BAG3O95817 575 aa20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 MYZAPP0CAP1 466 aa20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 GSCP56915 257 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 SPRED3Q2MJR0 410 aa20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 CD248Q9HCU0 757 aa20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 GOLGA6L10A6NI86 522 aa20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 E9PMD0 336 aa20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 KCNQ2O43526 872 aa20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 USP11P51784 963 aa20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 DDB1Q16531 1140 aa20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 CEP63Q96MT8 703 aa20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.6■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 SART1O43290 800 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 PPP4CP60510 307 aa20.59■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 QPCTQ16769 361 aa20.59■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 LRIG3Q6UXM1 1119 aa20.59■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.59■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa20.59■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 WNK3Q9BYP7 1800 aa20.59■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 KCNH2Q12809 1159 aa20.59■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.59■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.59■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.59■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.59■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 ITGA4P13612 1032 aa20.58■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC9A1P19634 815 aa20.58■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 METTL13Q8N6R0 699 aa20.58■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.58■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.58■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.58■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 PDHBP11177 359 aa20.58■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 CUL1Q13616 776 aa20.58■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
NEFHP1-201ENST00000412845 SBF2Q86WG5 1849 aa20.58■□□□□ 0.88
NEFHP1-201ENST00000412845 EPS15P42566 896 aa20.57■□□□□ 0.88
NEFHP1-201ENST00000412845 ADAM9Q13443 819 aa20.57■□□□□ 0.88
NEFHP1-201ENST00000412845 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.57■□□□□ 0.88
NEFHP1-201ENST00000412845 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
NEFHP1-201ENST00000412845 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NEFHP1-201ENST00000412845 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NEFHP1-201ENST00000412845 GMNCA6NCL1 334 aa20.57■□□□□ 0.88
NEFHP1-201ENST00000412845 SMARCA1P28370 1054 aa20.57■□□□□ 0.88
NEFHP1-201ENST00000412845 BTDP43251 543 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms