RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410499.1

RNU6-141P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 141, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-141P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-141P-201ENST00000410499 TTC28Q96AY4 2481 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 XDHP47989 1333 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 TNFRSF21O75509 655 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 UMODP07911 640 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 STAT5AP42229 794 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 CORO7P57737 925 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 USP10Q14694 798 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 JAMLQ86YT9 394 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 GPR135Q8IZ08 494 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 CFHR4Q92496 578 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 KATNBL1Q9H079 304 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 GP6Q9HCN6 339 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 AP5S1Q9NUS5 200 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 PCDHA4Q9UN74 947 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-141P-201ENST00000410499 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 RECQL4O94761 1208 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 HKR1P10072 659 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 CEP85LQ5SZL2 805 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF485Q8NCK3 441 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 HASPINQ8TF76 798 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 TJP2Q9UDY2 1190 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 SIT1Q9Y3P8 196 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 A0A1B0GU03 582 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 GRXCR1A8MXD5 290 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 TRIM37O94972 964 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 PDE6AP16499 860 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 CACNA2D1P54289 1103 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 C16orf46Q6P387 395 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 BARGINQ6ZT62 677 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 CABP7Q86V35 215 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 REXO1L1PQ8IX06 675 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 ANKRD35Q8N283 1001 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 REPS2Q8NFH8 660 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 SNX29Q8TEQ0 813 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 TMEM176AQ96HP8 235 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 MSL2Q9HCI7 577 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 TMEM39AQ9NV64 488 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZIM2Q9NZV7 527 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 PHGR1C9JFL3 82 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 ESRRBO95718 433 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 PRKCGP05129 697 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 GRK4P32298 578 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 MPLP40238 635 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP12-4P60329 112 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 PPP2R3AQ06190 1150 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 SLC1A5Q15758 541 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 BMT2Q1RMZ1 405 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 C8orf34Q49A92 452 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 TMC3Q7Z5M5 1100 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 NLGN2Q8NFZ4 835 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 SLC9A6Q92581 669 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 PLPPR2Q96GM1 343 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 WRNIP1Q96S55 665 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 ABCB6Q9NP58 842 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 SLC7A10Q9NS82 523 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 NR2E1Q9Y466 385 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF318Q5VUA4 2279 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 OAZ2O95190 189 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 NME2P22392 152 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 IRF9Q00978 393 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 TMEM79Q9BSE2 394 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 ASPNQ9BXN1 380 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 GPR87Q9BY21 358 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 NELFAQ9H3P2 528 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 CBX8Q9HC52 389 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 NRIP3Q9NQ35 241 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 MUC2Q02817 5179 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-141P-201ENST00000410499 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms