RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409529.6

CCDC138-202, Transcript of coiled-coil domain containing 138, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC138, Length 2,364 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138-202ENST00000409529 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 SFI1A8K8P3 1242 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 NOL4O94818 638 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 MOCS3O95396 460 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 ADAM9Q13443 819 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 Q4G0T1 1027 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 SFR1Q86XK3 245 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 HINFPQ9BQA5 517 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 JADE2Q9NQC1 790 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 DNM3Q9UQ16 869 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 ABCB11O95342 1321 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 ZBTB39O15060 712 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 CHMP2AO43633 222 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 MYBP10242 640 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 POLD1P28340 1107 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 ARID5AQ03989 594 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 BRD3Q15059 726 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 PDXDC1Q6P996 788 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 PSMB7Q99436 277 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 RAB21Q9UL25 225 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 RPA1P27694 616 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 OAS2P29728 719 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 VEZTQ9HBM0 779 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 VAV3Q9UKW4 847 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 TLR2O60603 784 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 ZMYND10O75800 440 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 SPDYE6P0CI01 402 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 NR2F2P24468 414 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 HOXD13P35453 343 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 STAT2P52630 851 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 GYS2P54840 703 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 KCNA1Q09470 495 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 ERMNQ8TAM6 284 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 WDR18Q9BV38 432 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 MMP14P50281 582 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 RASSF7Q02833 373 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 HGSNATQ68CP4 663 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 SH2D4AQ9H788 454 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 ATP8B1O43520 1251 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 BUB1O43683 1085 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 ACTN1P12814 892 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 CXCR5P32302 372 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 MAGEA1P43355 309 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 SLC15A2Q16348 729 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 CAGE1Q8TC20 777 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 H3BQF6 201 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 TBX3O15119 743 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 USO1O60763 962 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 TPH2Q8IWU9 490 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 COG1Q8WTW3 980 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 CEP63Q96MT8 703 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 MAP2K7O14733 419 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 NCK2O43639 380 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 CIITAP33076 1130 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC138-202ENST00000409529 C2orf54Q08AI8 447 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms