RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM265A0A087WTH1 108 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 DEXIO95424 95 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 DNAJB2P25686 324 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF76P36508 570 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 GPNMBQ14956 572 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 SERINC5Q86VE9 423 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 WNT8BQ93098 351 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM161BQ96MY7 647 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC9A2Q9UBY0 812 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM86B1E9PN63 330 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 SEC24BO95487 1268 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM86B2P0C5J1 330 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 SDF4Q9BRK5 362 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 CHD9Q3L8U1 2897 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-201ENST00000392415 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 TREHO43280 583 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 GNAT1P11488 350 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 ACTN1P12814 892 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 ADAM17P78536 824 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 SCRN1Q12765 414 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD1Q15327 319 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 TRAF7Q6Q0C0 670 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 RASGRP4Q8TDF6 673 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 GUCD1Q96NT3 240 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 PBX4Q9BYU1 374 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 SETD4Q9NVD3 440 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 PFKFB2O60825 505 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 LGR5O75473 907 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 AK2P54819 239 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 PLA2G4DQ86XP0 818 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 GBF1Q92538 1859 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 EMSYQ7Z589 1322 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 NRCAMQ92823 1304 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBBXA8MT70 800 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 CXCL10P02778 98 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 PBX2P40425 430 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 NLRP5P59047 1200 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 GLG1Q92896 1179 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 PCYT2Q99447 389 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 EYSQ5T1H1 3165 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 NBNO60934 754 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 CDKL5O76039 1030 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 ATG7O95352 703 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 CIITAP33076 1130 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 ACTR2P61160 394 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 TIFAQ96CG3 184 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 DHX15O43143 795 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 BAIAP3O94812 1187 aa23.41■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 THPOP40225 353 aa23.41■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 SETQ01105 290 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 MBTPS1Q14703 1052 aa23.41■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 RAB30Q15771 203 aa23.41■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 MYO9BQ13459 2157 aa23.41■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 EDIL3O43854 480 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 CAND2O75155 1236 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 MARK3P27448 753 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 GALNT17Q6IS24 598 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 AIFM3Q96NN9 605 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF576Q9H609 170 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 AZI2Q9H6S1 392 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 MSRAQ9UJ68 235 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 STK36Q9NRP7 1315 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 RSPH10B2B2RC85 870 aa23.39■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 M0R2N6 131 aa23.39■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 RSPH10BP0C881 870 aa23.39■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 USP11P51784 963 aa23.39■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 PPFIA1Q13136 1202 aa23.39■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 NPY5RQ15761 445 aa23.39■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.39■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.39■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 DAGLBQ8NCG7 672 aa23.39■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa23.39■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.39■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.39■■□□□ 1.34
UBE2E3-201ENST00000392415 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3-201ENST00000392415 CCNE2O96020 404 aa23.38■■□□□ 1.33
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