RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 PTPRSQ13332 1948 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 KAT6AQ92794 2004 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 LGR5O75473 907 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 MARK3P27448 753 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 PSMA5P28066 241 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 ADGRE1Q14246 886 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 TRAF7Q6Q0C0 670 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 MICALL1Q8N3F8 863 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 LMBR1Q8WVP7 490 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 SEPT1Q8WYJ6 367 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 MAFGO15525 162 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 RPS6KB1P23443 525 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 HOXC8P31273 242 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 ADD1P35611 737 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 DEFB103AP81534 67 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 AP3B2Q13367 1082 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 MBTPS1Q14703 1052 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 TEX2Q8IWB9 1127 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 MXRA8Q9BRK3 442 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 SDF4Q9BRK5 362 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 CAND2O75155 1236 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF76P36508 570 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 TMEM260Q9NX78 707 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 ERAP1Q9NZ08 941 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 CHD9Q3L8U1 2897 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 SCG2P13521 617 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 PPFIA1Q13136 1202 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 TCTN1Q2MV58 587 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 ARNTL2Q8WYA1 636 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 KCNH7Q9NS40 1196 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 NRCAMQ92823 1304 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 FAM117BQ6P1L5 589 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 AZI2Q9H6S1 392 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 SLC9A2Q9UBY0 812 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 A0A0C4DFX4 3053 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-202ENST00000378546 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 TAP1Q03518 808 aa29.07■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 CEP55Q53EZ4 464 aa29.07■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa29.07■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 DBF4BQ8NFT6 615 aa29.07■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 SEPT8Q92599 483 aa29.07■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa29.06■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa29.06■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 AMHP03971 560 aa29.06■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 SREBF1P36956 1147 aa29.06■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 CYP2W1Q8TAV3 490 aa29.06■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 C6orf50Q9HD87 102 aa29.06■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 MICAL3Q7RTP6 2002 aa29.06■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 NID2Q14112 1375 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 RFXAPO00287 272 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 IGBP1P78318 339 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 GRIK4Q16099 956 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 MYOCDQ8IZQ8 938 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 PRDM6Q9NQX0 595 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 TUBE1Q9UJT0 475 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 ARHGEF15O94989 841 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 GJB5O95377 273 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 ARP10275 920 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 TAF2Q6P1X5 1199 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 RSPH3Q86UC2 560 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 PHKBQ93100 1093 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 THEGQ9P2T0 379 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 TRPC6Q9Y210 931 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 NFASCO94856 1347 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 LCHNA4D1U4 455 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 PPFIA3O75145 1194 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 CLK2P49760 499 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 RAD9AQ99638 391 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 SLC26A6Q9BXS9 759 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 CHD7Q9P2D1 2997 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 ESYT2A0FGR8 921 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 ACTR2P61160 394 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 CCT2P78371 535 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 ADAM17P78536 824 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 RUFY4Q6ZNE9 571 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 RUFY3Q7L099 469 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-202ENST00000378546 EPOPA6NHQ4 379 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 GNA11P29992 359 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 MCTP2Q6DN12 878 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-202ENST00000378546 PLA2G4DQ86XP0 818 aa29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms