RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1328Q86T90 577 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 OTUD6BQ8N6M0 293 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM58Q8NG06 486 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 MASTLQ96GX5 879 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 SELENOOQ9BVL4 669 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CXorf56Q9H5V9 222 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 DONSONQ9NYP3 566 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC37AA6NMS7 1700 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CHD4Q14839 1912 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 MYH13Q9UKX3 1938 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CHUKO15111 745 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 USO1O60763 962 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 HSF2BPO75031 334 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 IL2RAP01589 272 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 SRGNP10124 158 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 GGCXP38435 758 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 HAND2P61296 217 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CDK17Q00537 523 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 PAK1Q13153 545 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM67Q5HYA8 995 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC122Q5T0U0 273 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 EMC10Q5UCC4 262 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ARMC9Q7Z3E5 817 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 MMGT1Q8N4V1 131 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 JAKMIP2Q96AA8 810 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJC7Q99615 494 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 SH3GL2Q99962 352 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 SLC26A6Q9BXS9 759 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.138e-25■■■■■ 264
CTPS1-201ENST00000372616 TIAM2Q8IVF5 1701 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF804BA4D1E1 1349 aa7.96□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 H0YIN7 160 aa7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 TEX33O43247 280 aa7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 TCP1P17987 556 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 TRAPPC10P48553 1259 aa7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 CCT5P48643 541 aa7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 CDR1P51861 262 aa7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 NEDD9Q14511 834 aa7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 TCP11X2Q5H9J9 407 aa7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 STYK1Q6J9G0 422 aa7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 MICU3Q86XE3 530 aa7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 SP8Q8IXZ3 490 aa7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA5Q8NB90 893 aa7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 P3H4Q92791 437 aa7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 CAVIN3Q969G5 261 aa7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 ALS2CR12Q96Q35 445 aa7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 DENND2AQ9ULE3 1009 aa7.96□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 DOCK2Q92608 1830 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFAB1O14561 156 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 APPP05067 770 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 GNAT2P19087 354 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 MCAMP43121 646 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 ZAP70P43403 619 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 PHKA1P46020 1223 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 DNM2P50570 870 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 VAV2P52735 878 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 KIF5AQ12840 1032 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 KRT31Q15323 416 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 RTN1Q16799 776 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 PI16Q6UXB8 463 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 GPR152Q8TDT2 470 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 CNKSR1Q969H4 720 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 PAGE5Q96GU1 130 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 THAP9Q9H5L6 903 aa7.95□□□□□ -1.14
CTPS1-201ENST00000372616 KAT14Q9H8E8 782 aa7.95□□□□□ -1.14
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