RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 USH1GQ495M9 461 aa26.37■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 ZCWPW2Q504Y3 356 aa26.37■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 FOXR1Q6PIV2 292 aa26.37■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 MYOCDQ8IZQ8 938 aa26.37■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 CNKSR1Q969H4 720 aa26.37■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa26.37■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 MED24O75448 989 aa26.37■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 PLA2G4BP0C869 781 aa26.37■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 ERCC3P19447 782 aa26.37■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 GGCXP38435 758 aa26.37■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 KRT26Q7Z3Y9 468 aa26.37■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 ETNPPLQ8TBG4 499 aa26.37■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa26.36■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 A0A1W2PRG0 241 aa26.36■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 ENTPD3O75355 529 aa26.36■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 SPIRE1Q08AE8 756 aa26.36■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM26FQ5R3K3 315 aa26.36■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 SYDE2Q5VT97 1194 aa26.36■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 MOXD1Q6UVY6 613 aa26.36■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 FBXO11Q86XK2 927 aa26.36■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D7Q9P0N9 293 aa26.36■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa26.36■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 KIF11P52732 1056 aa26.35■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa26.35■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 AGPSO00116 658 aa26.35■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 IKQ13123 557 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 PRR16Q569H4 304 aa26.35■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 FOXR2Q6PJQ5 311 aa26.35■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 LENG9Q96B70 501 aa26.35■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa26.35■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 CSRNP1Q96S65 589 aa26.35■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 OPLAHO14841 1288 aa26.34■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 BMP3P12645 472 aa26.34■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 GPBP1Q86WP2 473 aa26.34■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 SLFN12Q8IYM2 578 aa26.34■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 TSG101Q99816 390 aa26.34■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 SMCHD1A6NHR9 2005 aa26.34■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 PPFIA4O75335 1185 aa26.34■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP11B2P19099 503 aa26.34■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 ALS2CR12Q96Q35 445 aa26.34■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 POTEFA5A3E0 1075 aa26.33■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 GOLGA6BA6NDN3 693 aa26.33■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM86B1E9PN63 330 aa26.33■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM86B2P0C5J1 330 aa26.33■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 POTEIP0CG38 1075 aa26.33■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 TCP1P17987 556 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 MMP14P50281 582 aa26.33■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 POTEGQ6S5H5 508 aa26.33■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 POTEEQ6S8J3 1075 aa26.33■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 SPICE1Q8N0Z3 855 aa26.33■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 DEF6Q9H4E7 631 aa26.33■■□□□ 1.81
AMIGO1-201ENST00000369862 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 Q4G0T1 1027 aa26.33■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 ARSHQ5FYA8 562 aa26.33■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.33■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 MLXIPQ9HAP2 919 aa26.33■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 PPIP5K2O43314 1243 aa26.32■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC12A3P55017 1021 aa26.32■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 BTNL9Q6UXG8 535 aa26.32■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 CATSPER3Q86XQ3 398 aa26.32■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC155Q8N6L0 562 aa26.32■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATA4Q8NEY3 305 aa26.32■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 MMRN2Q9H8L6 949 aa26.32■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 HYOU1Q9Y4L1 999 aa26.32■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 MOCS3O95396 460 aa26.31■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 SREBF1P36956 1147 aa26.31■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC65Q8IXS2 484 aa26.31■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 OSBPL9Q96SU4 736 aa26.31■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 RSPH14Q9UHP6 348 aa26.31■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC26A4O43511 780 aa26.31■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 AKR1B10O60218 316 aa26.31■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM76AQ8TAV0 307 aa26.31■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 SPDYE3A6NKU9 549 aa26.3■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 TRAF5O00463 557 aa26.3■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 ECE1P42892 770 aa26.3■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 PSMC6P62333 389 aa26.3■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 NELFCDQ8IXH7 590 aa26.3■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC1Q9BTT6 524 aa26.3■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.3■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 FRMD3A2A2Y4 597 aa26.3■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 PJA2O43164 708 aa26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms