RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368632.6

HDAC2-201, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HDAC2, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-201ENST00000368632 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 USP17L19D6RCP7 530 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 USP17L20D6RJB6 530 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 OPA1O60313 960 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 PPFIA4O75335 1185 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 APBA1Q02410 837 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 USP17L24Q0WX57 530 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 ADAM9Q13443 819 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 ASIC2Q16515 512 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 C10orf67Q8IYJ2 551 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 CERS5Q8N5B7 392 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 ANO3Q9BYT9 981 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 USP11P51784 963 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 SH3GL2Q99962 352 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 TRIM66O15016 1216 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 CETN3O15182 167 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 MED24O75448 989 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 KLRC1P26715 233 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 ARID5AQ03989 594 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 ALS2CLQ60I27 953 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 GANQ9H2C0 597 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 HSF2BPO75031 334 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 FTCDO95954 541 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 STAT3P40763 770 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 SLC12A3P55017 1021 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 NNTQ13423 1086 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 SP8Q8IXZ3 490 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 IFT20Q8IY31 132 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 RUFY1Q96T51 708 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 USP21Q9UK80 565 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 A0A087X0T9 212 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 GRID2IPA4D2P6 1211 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 FAM228BP0C875 321 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 CYP3A7P24462 503 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 SCNN1DP51172 638 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 KCNH2Q12809 1159 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 PPFIA1Q13136 1202 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 MEI1Q5TIA1 1274 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 MBOAT7Q96N66 472 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 POTEFA5A3E0 1075 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 RAD21O60216 631 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 POTEIP0CG38 1075 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 NR2F2P24468 414 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 DNA2P51530 1060 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 ARSHQ5FYA8 562 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 POTEGQ6S5H5 508 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC2-201ENST00000368632 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 CCDC17Q96LX7 622 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 MXD3Q9BW11 206 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 GDF3Q9NR23 364 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 DDR1Q08345 913 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 AP3B2Q13367 1082 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 GBP6Q6ZN66 633 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 DCAF4Q8WV16 495 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 EHD4Q9H223 541 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 TOM1O60784 492 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 GLI1P08151 1106 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 CASP5P51878 434 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 PAK2Q13177 524 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 ERMNQ8TAM6 284 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 SLURP2P0DP57 97 aa22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms