RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM94Q12767 1356 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 SERPINB6P35237 376 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF653Q96CK0 615 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 FMO2Q99518 471 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 PPCSQ9HAB8 311 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 ANO9A1A5B4 782 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 ITKQ08881 620 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 EFHBQ8N7U6 833 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 KCTD6Q8NC69 237 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 ERBB3P21860 1342 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 HEG1Q9ULI3 1381 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 DLC1Q96QB1 1528 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 ASNSP08243 561 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 TAC1P20366 129 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 POLA2Q14181 598 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 EXOC4Q96A65 974 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 TJP3O95049 919 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 CENPUQ71F23 418 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 RASEFQ8IZ41 740 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD42Q8N9B4 389 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 H7C0C1 242 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 MAP3K7O43318 606 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 SFNP31947 248 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 ATP5OP48047 213 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM4Q9C037 500 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 LRMPQ12912 555 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 ORAI2Q96SN7 254 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 RASGRF2O14827 1237 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 PMLP29590 882 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 AP3M2P53677 418 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 PSMB7Q99436 277 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 KLC2Q9H0B6 622 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 PYGBP11216 843 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 CASP14P31944 242 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 VSTM4Q8IW00 320 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 CDHR2Q9BYE9 1310 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 LRRD1A4D1F6 860 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 BMP3P12645 472 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 GYG1P46976 350 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 GUCY2DQ02846 1103 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 AKT3Q9Y243 479 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 DCTN3O75935 186 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 SEC24BO95487 1268 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 PYGLP06737 847 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 ADD2P35612 726 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 GIPC2Q8TF65 315 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 TLK1Q9UKI8 766 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 TXNDC9O14530 226 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 SKIP12755 728 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 MECOMQ03112 1051 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 DESI2Q9BSY9 194 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 KCND2Q9NZV8 630 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-201ENST00000356100 CCNE1P24864 410 aa6.48□□□□□ -1.37
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