RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

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Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 PPP2R5CQ13362 524 aa25.32■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 SFR1Q86XK3 245 aa25.32■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.32■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 MTFR1LQ9H019 292 aa25.32■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa25.32■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 EYA4O95677 639 aa25.31■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 CCDC40Q4G0X9 1142 aa25.31■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.31■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.31■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 MMRN2Q9H8L6 949 aa25.31■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 HERVK_113P62684 666 aa25.3■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 DGKZQ13574 1117 aa25.3■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 MICALL2Q8IY33 904 aa25.3■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 SLC35F6Q8N357 371 aa25.3■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
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SNX18-201ENST00000326277 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
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SNX18-201ENST00000326277 ARP10275 920 aa25.3■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 HSD17B4P51659 736 aa25.3■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 PPP2R3AQ06190 1150 aa25.3■■□□□ 1.64
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SNX18-201ENST00000326277 KCTD17Q8N5Z5 321 aa25.3■■□□□ 1.64
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SNX18-201ENST00000326277 LPAR1Q92633 364 aa25.3■■□□□ 1.64
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SNX18-201ENST00000326277 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.3■■□□□ 1.64
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SNX18-201ENST00000326277 BCS1LQ9Y276 419 aa25.3■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 EFCAB8A8MWE9 144 aa25.29■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 RSPH10B2B2RC85 870 aa25.29■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 RSPH10BP0C881 870 aa25.29■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 TPH2Q8IWU9 490 aa25.29■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
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SNX18-201ENST00000326277 HOOK2Q96ED9 719 aa25.29■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 TRIM10Q9UDY6 481 aa25.29■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 GNA14O95837 355 aa25.28■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 PRELPP51888 382 aa25.28■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 CDK17Q00537 523 aa25.28■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.28■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 MYO1AQ9UBC5 1043 aa25.28■■□□□ 1.64
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SNX18-201ENST00000326277 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
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SNX18-201ENST00000326277 SETQ01105 290 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 KCNMA1Q12791 1236 aa25.27■■□□□ 1.64
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SNX18-201ENST00000326277 BCAS3Q9H6U6 928 aa25.27■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 HACL1Q9UJ83 578 aa25.27■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 GUCA1BQ9UMX6 200 aa25.27■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.27■■□□□ 1.64
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SNX18-201ENST00000326277 MYBP10242 640 aa25.27■■□□□ 1.64
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SNX18-201ENST00000326277 RASSF7Q02833 373 aa25.27■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 TRIM59Q8IWR1 403 aa25.27■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 UNC45AQ9H3U1 944 aa25.27■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 HAUS4Q9H6D7 363 aa25.27■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 TFR2Q9UP52 801 aa25.27■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 TBCAO75347 108 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 CPXCR1Q8N123 301 aa25.26■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 WDR11Q9BZH6 1224 aa25.26■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 ZBTB39O15060 712 aa25.25■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.25■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 GINM1Q9NU53 330 aa25.25■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa25.25■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 ITGB5P18084 799 aa25.25■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 NR2F2P24468 414 aa25.25■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 NEK11Q8NG66 645 aa25.25■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SNX18-201ENST00000326277 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
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