RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318066.6

UBE2N-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 N, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2N, Length 5,186 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2N-201ENST00000318066 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 CENPKQ9BS16 269 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 DONSONQ9NYP3 566 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 KCNQ3O43525 872 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 BRD2P25440 801 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 SPARCL1Q14515 664 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 TERF2Q15554 542 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 NUDCD1Q96RS6 583 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 IQCB1Q15051 598 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 PTPROQ16827 1216 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 RESP18Q5W5W9 173 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 TTC25Q96NG3 672 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 GNGT2O14610 69 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 FTCDO95954 541 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 APOEP02649 317 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 MX2P20592 715 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 CA4P22748 312 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 PCGF5Q86SE9 256 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 GRM1Q13255 1194 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 KRT31Q15323 416 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 GFPT2O94808 682 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 CCNA1P78396 465 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 CEP72Q9P209 647 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 PLA2G4BP0C869 781 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 ART3Q13508 389 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 ATP8B3O60423 1300 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 M0R2C6 588 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 E2F5Q15329 346 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 SAT1P21673 171 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 AP3B2Q13367 1082 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 UNC13DQ70J99 1090 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 FAM160B2Q86V87 743 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 MORC4Q8TE76 937 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 GIPC2Q8TF65 315 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 PRPSAP2O60256 369 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 BBOX1O75936 387 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 CHEK2O96017 543 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 PYROXD1Q8WU10 500 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 TRIM55Q9BYV6 548 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 LGALS16A8MUM7 142 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 RPSAP08865 295 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 BASP1P80723 227 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 METTL23Q86XA0 190 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 ATP6V1E2Q96A05 226 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 PLCG1P19174 1290 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 ADORA1P30542 326 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 SNX25Q9H3E2 840 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 TJP3O95049 919 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 BMP3P12645 472 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 VPS39Q96JC1 886 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 PTCH1Q13635 1447 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 KLC3Q6P597 504 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 CRLF3Q8IUI8 442 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 MYO1EQ12965 1108 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 STOML1Q9UBI4 398 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 ZMYND10O75800 440 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 KCTD2Q14681 263 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 FSCBQ5H9T9 825 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 KCTD6Q8NC69 237 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
UBE2N-201ENST00000318066 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms