RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 CACNB3P54284 484 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 MSL1Q68DK7 614 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 USP17L10C9JJH3 530 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 RPSAP08865 295 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 GRIK3Q13003 919 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 PDIA5Q14554 519 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 PODNQ7Z5L7 613 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 FAM228AQ86W67 206 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 MMS19Q96T76 1030 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 RASSF9O75901 435 aa22.17■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 CDK17Q00537 523 aa22.17■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.17■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 CUL5Q93034 780 aa22.17■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.17■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 SH3GL2Q99962 352 aa22.17■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 ZBTB5O15062 677 aa22.17■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 PLSCR1O15162 318 aa22.17■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 NAA25Q14CX7 972 aa22.17■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.17■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.17■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 RAD54LQ92698 747 aa22.17■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 FAM196BA6NMK8 535 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 EPHB6O15197 1021 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 ZNF185O15231 689 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 APBA3O96018 575 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 KCNK18Q7Z418 384 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 CCDC17Q96LX7 622 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 RAB34Q9BZG1 259 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 IDEP14735 1019 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 EHHADHQ08426 723 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 TCP10Q12799 353 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 MTMR8Q96EF0 704 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 BORCS6Q96GS4 357 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 SLX4Q8IY92 1834 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 KRT86O43790 486 aa22.15■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 ZEB2O60315 1214 aa22.15■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 ATP1A2P50993 1020 aa22.15■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 SMTNP53814 917 aa22.15■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.15■■□□□ 1.14
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HPS6-201ENST00000299238 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.15■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 PEX19P40855 299 aa22.15■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 VWA3BQ502W6 1294 aa22.15■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.15■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.15■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.15■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.15■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 TATDN2Q93075 761 aa22.15■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 VCPKMTQ9H867 229 aa22.15■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 SAR1BQ9Y6B6 198 aa22.15■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 ZNF263O14978 683 aa22.14■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 LRRC41Q15345 812 aa22.14■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.14■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 ARL8AQ96BM9 186 aa22.14■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 SCLT1Q96NL6 688 aa22.14■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 GCKP35557 465 aa22.14■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 NDST4Q9H3R1 872 aa22.14■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 ABCB11O95342 1321 aa22.14■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 RAD21O60216 631 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 AP1G2O75843 785 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 ECM1Q16610 540 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 DACT2Q5SW24 774 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 HAS1Q92839 578 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 IQCDQ96DY2 449 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 ECE2O60344 883 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
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