RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297615.9

TTC39B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 39B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene TTC39B, Length 3,053 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39B-201ENST00000297615 C7orf25Q9BPX7 421 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 FTCDO95954 541 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 CAPN2P17655 700 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 CYP2C19P33261 490 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 KRT83P78385 493 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 SLC15A2Q16348 729 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 NSMFQ6X4W1 530 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 MYCT1Q8N699 235 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 REEP2Q9BRK0 252 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 HAUS4Q9H6D7 363 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 MSH4O15457 936 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 ARP10275 920 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 NR2F2P24468 414 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 SOX10P56693 466 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 BRD3Q15059 726 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 VWA3BQ502W6 1294 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 ARSHQ5FYA8 562 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 NFRKBQ6P4R8 1299 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 UNC13DQ70J99 1090 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 DYDC2Q96IM9 177 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 PACSIN1Q9BY11 444 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 STK32BQ9NY57 414 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 SWAP70Q9UH65 585 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 MYH10P35580 1976 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 GPS2Q13227 327 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 KCNB1Q14721 858 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 COG1Q8WTW3 980 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 HDAC7Q8WUI4 952 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 AK8Q96MA6 479 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 CYP11B2P19099 503 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 DNAJC7Q99615 494 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 MYBL2P10244 700 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 INPP5BP32019 993 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 USP8P40818 1118 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 PRPHP41219 470 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 ZBED6P86452 979 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 CCDC181Q5TID7 509 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 MYH1P12882 1939 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 OPLAHO14841 1288 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 SNHG28P0DPA3 235 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 STAT2P52630 851 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 DNM3Q9UQ16 869 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 NFIBO00712 420 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 KIF11P52732 1056 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 TTLL6Q8N841 843 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 TSG101Q99816 390 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 LAD1O00515 517 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 TRIM49P0CI25 452 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 TRIM49CP0CI26 452 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 MAGEA1P43355 309 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 CNKSR1Q969H4 720 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 CCDC17Q96LX7 622 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 L1RE1Q9UN81 338 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 ESYT3A0FGR9 886 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 AMPD2Q01433 879 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 IL31RAQ8NI17 732 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 WNK3Q9BYP7 1800 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 GOLGA8IPA6NC78 632 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 KCNMA1Q12791 1236 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 WDR18Q9BV38 432 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 CALCAP01258 141 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 RASA3Q14644 834 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms