RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 GLG1Q92896 1179 aa21.56■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 TIFAQ96CG3 184 aa21.56■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.56■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 AZI2Q9H6S1 392 aa21.56■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.56■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.55■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 ZBBXA8MT70 800 aa21.55■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 CYP2W1Q8TAV3 490 aa21.55■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa21.55■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 ARP10275 920 aa21.54■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 STK3Q13188 491 aa21.54■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.54■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.54■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 VWCEQ96DN2 955 aa21.54■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.54■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.54■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 EMSYQ7Z589 1322 aa21.54■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 LAMA3Q16787 3333 aa21.54■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 EFCAB14O75071 495 aa21.53■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 LGR5O75473 907 aa21.53■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 CXCL10P02778 98 aa21.53■■□□□ 1.04
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MALSU1-201ENST00000287543 XBP1P17861 261 aa21.53■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 CIITAP33076 1130 aa21.53■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 THPOP40225 353 aa21.53■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 USP11P51784 963 aa21.53■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 TRIM50Q86XT4 487 aa21.53■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 SLC9A7Q96T83 725 aa21.53■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
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MALSU1-201ENST00000287543 TBC1D22BQ9NU19 505 aa21.53■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 SETD4Q9NVD3 440 aa21.53■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.53■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 RSPH10B2B2RC85 870 aa21.52■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 FAM86B1E9PN63 330 aa21.52■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 TREHO43280 583 aa21.52■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 PFKFB2O60825 505 aa21.52■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 PPFIA3O75145 1194 aa21.52■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.52■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 RSPH10BP0C881 870 aa21.52■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 SLC26A2P50443 739 aa21.52■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 ACTR2P61160 394 aa21.52■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 HIC1Q14526 733 aa21.52■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.52■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.52■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.52■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.52■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 FAM161BQ96MY7 647 aa21.52■■□□□ 1.04
MALSU1-201ENST00000287543 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa21.52■■□□□ 1.04
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MALSU1-201ENST00000287543 GUCD1Q96NT3 240 aa21.51■■□□□ 1.03
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.51■■□□□ 1.03
MALSU1-201ENST00000287543 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF576Q9H609 170 aa21.51■■□□□ 1.03
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MALSU1-201ENST00000287543 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.51■■□□□ 1.03
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MALSU1-201ENST00000287543 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.5■■□□□ 1.03
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MALSU1-201ENST00000287543 ATG7O95352 703 aa21.5■■□□□ 1.03
MALSU1-201ENST00000287543 KCNJ6P48051 423 aa21.5■■□□□ 1.03
MALSU1-201ENST00000287543 STAT5BP51692 787 aa21.5■■□□□ 1.03
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MALSU1-201ENST00000287543 AK2P54819 239 aa21.49■■□□□ 1.03
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MALSU1-201ENST00000287543 SLC28A3Q9HAS3 691 aa21.49■■□□□ 1.03
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MALSU1-201ENST00000287543 PBX2P40425 430 aa21.48■■□□□ 1.03
MALSU1-201ENST00000287543 NEK4P51957 841 aa21.48■■□□□ 1.03
MALSU1-201ENST00000287543 PRR16Q569H4 304 aa21.48■■□□□ 1.03
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
MALSU1-201ENST00000287543 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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