RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 ERGIC2Q96RQ1 377 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 TAOK3Q9H2K8 898 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 PKD2L1Q9P0L9 805 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 EXOC3L4Q17RC7 722 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 GDAP1Q8TB36 358 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 RASAL2Q9UJF2 1139 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 GRIN2DO15399 1336 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 A0A1W2PRG0 241 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 LRRN2O75325 713 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 ADCY7P51828 1080 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 KIAA0895Q8NCT3 520 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 RNF14Q9UBS8 474 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 E9PMD0 336 aa16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 GCNT3O95395 438 aa16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP16.69■□□□□ 0.263e-16■■■■□ 26.7
USP25-201ENST00000285679 NBPF9Q3BBW0 867 aa16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 GRIPAP1Q4V328 841 aa16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SYCP3Q8IZU3 236 aa16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CNPY4Q8N129 248 aa16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 PSMD1Q99460 953 aa16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CCSER1Q9C0I3 900 aa16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 TBK1Q9UHD2 729 aa16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CHMP2AO43633 222 aa16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 AK8Q96MA6 479 aa16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 PLA2G12BQ9BX93 195 aa16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CUEDC2Q9H467 287 aa16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 VCPKMTQ9H867 229 aa16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 KBTBD4Q9NVX7 518 aa16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 MYL1P05976 194 aa16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 UNC13DQ70J99 1090 aa16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 NLRP3Q96P20 1036 aa16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa16.69■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 MYBL1P10243 752 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SLC16A2P36021 539 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 ERFP50548 548 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 RCAN1P53805 252 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 KLHL29Q96CT2 875 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 ITGA4P13612 1032 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 TNFAIP3P21580 790 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 KIF2BQ8N4N8 673 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 VGLL2Q8N8G2 317 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 RAPGEF5Q92565 580 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 IQCDQ96DY2 449 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 TMEM47Q9BQJ4 181 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SFI1A8K8P3 1242 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CLGNO14967 610 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 PAX7P23759 505 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 PCK1P35558 622 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 KCNH2Q12809 1159 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 USP38Q8NB14 1042 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SH3GL2Q99962 352 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 BRIP1Q9BX63 1249 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 ADAM33Q9BZ11 813 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CEP72Q9P209 647 aa16.68■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 KLRC4O43908 158 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 ERVK-9P63128 1117 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CALCOCO2Q13137 446 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 MIIPQ5JXC2 388 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 AZI2Q9H6S1 392 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 STRCQ7RTU9 1775 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SPOPO43791 374 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SLC9A1P19634 815 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SGSM3Q96HU1 749 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 RAB17Q9H0T7 212 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 ASIC3Q9UHC3 531 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 HDAC9Q9UKV0 1011 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 L3MBTL1Q9Y468 752 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 RIC1Q4ADV7 1423 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 KLRK1P26718 216 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 STAT1P42224 750 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SESN3P58005 492 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 LRRC63Q05C16 580 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 VSIG1Q86XK7 387 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SPDL1Q96EA4 605 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 EMILIN3Q9NT22 766 aa16.67■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 LAMA4Q16363 1823 aa16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms