RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272133.3

CNIH3-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH3, Length 2,558 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-201ENST00000272133 GRIK5Q16478 980 aa20.51■□□□□ 0.87
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CNIH3-201ENST00000272133 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.46■□□□□ 0.87
CNIH3-201ENST00000272133 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
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CNIH3-201ENST00000272133 ADCY7P51828 1080 aa20.45■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.45■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.45■□□□□ 0.86
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