RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 NELFCDQ8IXH7 590 aa16.4■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 KLHL7Q8IXQ5 586 aa16.4■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 GANQ9H2C0 597 aa16.4■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa16.4■□□□□ 0.22
SYP-201ENST00000263233 ATAD5Q96QE3 1844 aa16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 RGL2O15211 777 aa16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 PPP1R37O75864 691 aa16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 GNA14O95837 355 aa16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 TNNI2P48788 182 aa16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 TNNC1P63316 161 aa16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 ASIC2Q16515 512 aa16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 PTGISQ16647 500 aa16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 PPP4R3AQ6IN85 833 aa16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 PAGR1Q9BTK6 254 aa16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 PLAAQ9Y263 795 aa16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 VPS72Q15906 364 aa16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 UBE2SQ16763 222 aa16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 MCTP2Q6DN12 878 aa16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 TEX11Q8IYF3 940 aa16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 CNPY4Q8N129 248 aa16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 NARFQ9UHQ1 456 aa16.39■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 ECHS1P30084 290 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 MDH1P40925 334 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 FNTAP49354 379 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 ERVK-9P63128 1117 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 TPTE2Q6XPS3 522 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 OTUD6BQ8N6M0 293 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 ISCUQ9H1K1 167 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 KCTD10Q9H3F6 313 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 YY1AP1Q9H869 796 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 LEMD3Q9Y2U8 911 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 CAPN7Q9Y6W3 813 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 BTNL10A8MVZ5 291 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 E9PMD0 336 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 CES2O00748 559 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 KCNK3O14649 394 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 KIAA0754O94854 1291 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 SEC24CP53992 1094 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 CEP85LQ5SZL2 805 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 MAATS1Q7Z4T9 603 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 SCFD1Q8WVM8 642 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 TMBIM4Q9HC24 238 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 NHSQ6T4R5 1651 aa16.38■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 RPS6KA1Q15418 735 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 HYIQ5T013 277 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 TAF4BQ92750 862 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 CEP89Q96ST8 783 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 PLCB1Q9NQ66 1216 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 MYH4Q9Y623 1939 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 ZNF831Q5JPB2 1677 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 FSBPO95073 299 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 KIF4AO95239 1232 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 CLK2P49760 499 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 PTK2Q05397 1052 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 NFIXQ14938 502 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 ZNF804AQ7Z570 1209 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 NLRP14Q86W24 1093 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 CCDC65Q8IXS2 484 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 SCFD2Q8WU76 684 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 CCT8L2Q96SF2 557 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 GOLPH3Q9H4A6 298 aa16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 HSD17B3P37058 310 aa16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 USP11P51784 963 aa16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 KCNH2Q12809 1159 aa16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 ADAM9Q13443 819 aa16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 ASPRV1Q53RT3 343 aa16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 GPCPD1Q9NPB8 672 aa16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 H0YGN5 161 aa16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 PLA2G4BP0C869 781 aa16.36■□□□□ 0.21
SYP-201ENST00000263233 ACTN1P12814 892 aa16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms