RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257290.9

PDGFRA-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRA, Length 6,576 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRA-201ENST00000257290 C6orf183Q5T699 404 aa7.28□□□□□ -1.24
PDGFRA-201ENST00000257290 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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PDGFRA-201ENST00000257290 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.28□□□□□ -1.24
PDGFRA-201ENST00000257290 CENPOQ9BU64 300 aa7.28□□□□□ -1.24
PDGFRA-201ENST00000257290 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDGFRA-201ENST00000257290 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDGFRA-201ENST00000257290 COL19A1Q14993 1142 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDGFRA-201ENST00000257290 NCAPH2Q6IBW4 605 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDGFRA-201ENST00000257290 S100A5P33763 92 aa7.27□□□□□ -1.25
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PDGFRA-201ENST00000257290 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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PDGFRA-201ENST00000257290 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7.27□□□□□ -1.25
PDGFRA-201ENST00000257290 TMEM5Q9Y2B1 443 aa7.27□□□□□ -1.25
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PDGFRA-201ENST00000257290 DCAF8L1A6NGE4 600 aa7.27□□□□□ -1.25
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PDGFRA-201ENST00000257290 HOXA2O43364 376 aa7.27□□□□□ -1.25
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PDGFRA-201ENST00000257290 GAS8O95995 478 aa7.27□□□□□ -1.25
PDGFRA-201ENST00000257290 BFSP1Q12934 665 aa7.27□□□□□ -1.25
PDGFRA-201ENST00000257290 NR1D2Q14995 579 aa7.27□□□□□ -1.25
PDGFRA-201ENST00000257290 WLSQ5T9L3 541 aa7.27□□□□□ -1.25
PDGFRA-201ENST00000257290 EMBQ6PCB8 327 aa7.27□□□□□ -1.25
PDGFRA-201ENST00000257290 IFNL1Q8IU54 200 aa7.27□□□□□ -1.25
PDGFRA-201ENST00000257290 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDGFRA-201ENST00000257290 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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