RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215919.3

PATZ1-201, Transcript of POZ/BTB and AT hook containing zinc finger 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PATZ1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATZ1-201ENST00000215919 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.23■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.23■■□□□ 1.15
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PATZ1-201ENST00000215919 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 GJA10Q969M2 543 aa22.23■■□□□ 1.15
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PATZ1-201ENST00000215919 NYAP2Q9P242 653 aa22.23■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.23■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 KLK7P49862 253 aa22.22■■□□□ 1.15
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PATZ1-201ENST00000215919 E2F5Q15329 346 aa22.22■■□□□ 1.15
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PATZ1-201ENST00000215919 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.22■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 NUP58Q9BVL2 599 aa22.22■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 SCN9AQ15858 1988 aa22.22■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 APBA3O96018 575 aa22.22■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.22■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 RETREG2Q8NC44 543 aa22.22■■□□□ 1.15
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PATZ1-201ENST00000215919 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.22■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 A0A1B0GUA9 196 aa22.21■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 TMCO5BA8MYB1 307 aa22.21■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 RPSAP08865 295 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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PATZ1-201ENST00000215919 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.21■■□□□ 1.15
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PATZ1-201ENST00000215919 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.21■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 USP17L15C9J2P7 530 aa22.21■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.21■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 USP17L11C9JVI0 530 aa22.21■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 USP17L18D6R9N7 530 aa22.21■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 USP17L22D6RA61 530 aa22.21■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.21■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 USP17L19D6RCP7 530 aa22.21■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 USP17L20D6RJB6 530 aa22.21■■□□□ 1.15
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PATZ1-201ENST00000215919 USP17L24Q0WX57 530 aa22.21■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 GRIK3Q13003 919 aa22.21■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 MSL1Q68DK7 614 aa22.21■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.21■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.21■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 SCLT1Q96NL6 688 aa22.21■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.21■■□□□ 1.15
PATZ1-201ENST00000215919 ZEB2O60315 1214 aa22.2■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 RASSF9O75901 435 aa22.2■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 SLC1A4P43007 532 aa22.2■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.2■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 DCAF4Q8WV16 495 aa22.2■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 VCPKMTQ9H867 229 aa22.2■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.2■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
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PATZ1-201ENST00000215919 SLFN13Q68D06 897 aa22.2■■□□□ 1.14
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PATZ1-201ENST00000215919 SH3GL2Q99962 352 aa22.2■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.2■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 ENC1O14682 589 aa22.19■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 ECE2O60344 883 aa22.19■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 CDR1P51861 262 aa22.19■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
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PATZ1-201ENST00000215919 HYIQ5T013 277 aa22.19■■□□□ 1.14
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PATZ1-201ENST00000215919 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.19■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 ATP1A2P50993 1020 aa22.19■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 PSMD2Q13200 908 aa22.19■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 SEPT2Q15019 361 aa22.19■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 FIGNQ5HY92 759 aa22.19■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.19■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.19■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.19■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.19■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 SRGAP2O75044 1071 aa22.18■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 IDEP14735 1019 aa22.18■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 PEX19P40855 299 aa22.18■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 HERVK_113P62684 666 aa22.18■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 ZBED6P86452 979 aa22.18■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 AP1ARQ63HQ0 302 aa22.18■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.18■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 RAD21O60216 631 aa22.18■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 SNCBQ16143 134 aa22.18■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 STYK1Q6J9G0 422 aa22.18■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 FAM228AQ86W67 206 aa22.18■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.18■■□□□ 1.14
PATZ1-201ENST00000215919 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.18■■□□□ 1.14
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