RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cyfip1Q7TMB8 1253 aa31.99■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ddx41Q91VN6 622 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AacsQ9D2R0 672 aa31.99■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc105Q9D4K7 499 aa31.99■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MsraQ9D6Y7 233 aa31.99■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ece1Q4PZA2 769 aa31.98■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Krt14Q61781 484 aa31.98■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tanc1Q0VGY8 1856 aa31.98■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Per1O35973 1291 aa31.98■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pak1O88643 545 aa31.98■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Foxn3Q499D0 457 aa31.98■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mcm7Q61881 719 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kdm1aQ6ZQ88 853 aa31.98■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rhobtb3Q9CTN4 611 aa31.98■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Serpinb12Q9D7P9 423 aa31.98■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr67F8VPJ8 320 aa31.97■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nek1P51954 1203 aa31.97■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Muc1Q02496 630 aa31.97■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cyp4f37Q3V1F1 546 aa31.97■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lrrc56Q8K375 552 aa31.97■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Orc4O88708 433 aa31.96■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 TxnP10639 105 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PpardP35396 440 aa31.96■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tnfaip8l3Q3TBL6 204 aa31.96■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tdp1Q8BJ37 609 aa31.96■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Btnl9Q8BJE2 536 aa31.96■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Azin2Q8BVM4 459 aa31.96■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 EtnpplQ8BWU8 499 aa31.96■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hdhd5Q91WM2 419 aa31.96■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pcdha12Q91Y18 950 aa31.96■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fgd4Q91ZT5 766 aa31.96■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 YwhabQ9CQV8 246 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MymkQ9D1N4 221 aa31.96■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cfap45Q9D9U9 551 aa31.96■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 4932429P05RikA2ADI4 785 aa31.95■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arhgef10lA2AWP8 1280 aa31.95■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cspp1B2RX88 1205 aa31.95■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Prpmp5E9PXN1 296 aa31.95■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Samsn1P57725 372 aa31.95■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cep126Q0VBV7 1103 aa31.95■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rasip1Q3U0S6 961 aa31.95■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Serpinb3dQ6UKZ0 387 aa31.95■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pnma1Q8C1C8 353 aa31.95■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rbm41Q8JZV4 413 aa31.95■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tab2Q99K90 693 aa31.95■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 RnmtQ9D0L8 465 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 UgcgO88693 394 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Idh1O88844 414 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hoxc6P10629 235 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm3414Q3TNU4 584 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hook2Q7TMK6 716 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cdkn2aipQ8BI72 563 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Bcas3Q8CCN5 928 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cbx6Q9DBY5 414 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Phtf1Q9QZ09 761 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Skint7A7XV04 395 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm973E9Q295 1059 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AurkbO70126 345 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Syt2P46097 422 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 EdnrbP48302 442 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Adcy5P84309 1262 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nlrp4cQ3TKR3 982 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc9a2Q3ZAS0 814 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Scarf1Q5ND28 820 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Herc4Q6PAV2 1057 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ankk1Q8BZ25 745 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NelfbQ8C4Y3 580 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rab3il1Q8VDV3 383 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tor1aip1Q921T2 595 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pstpip2Q99M15 334 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nek3Q9R0A5 511 aa31.94■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zscan25B2RX31 543 aa31.93■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tpd52Q62393 224 aa31.93■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Smchd1Q6P5D8 2007 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mcph1Q7TT79 822 aa31.93■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ddx39aQ8VDW0 427 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm4307E9PZY4 289 aa31.92■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm4312K9J7E2 289 aa31.92■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MafbP54841 323 aa31.92■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pstpip1P97814 415 aa31.92■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam214aQ69ZK7 1075 aa31.92■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Apol10aQ8CCA5 318 aa31.92■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atp2a1Q8R429 994 aa31.92■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dis3Q9CSH3 958 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmem192Q9CXT7 266 aa31.92■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mov10P23249 1004 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PklrP53657 574 aa31.91■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NfiaQ02780 532 aa31.91■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppp1r13bQ62415 1087 aa31.91■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PpihQ9D868 188 aa31.91■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kmt2eQ3UG20 1868 aa31.91■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ddx23D3Z0M9 819 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vmn2r79E9Q067 851 aa31.9■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pla2g4bP0C871 782 aa31.9■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cacna2d4Q5RJF7 1116 aa31.9■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ipo5Q8BKC5 1097 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Btbd7Q8CFE5 1130 aa31.9■■■□□ 2.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cypt1Q8CH20 168 aa31.9■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.9 ms