RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W ATP11P32453 318 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W HXT1P32465 570 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SUA5P32579 426 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W OAF3P36023 863 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W MCD4P36051 919 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W AIM29P36154 155 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W AKL1P38080 1108 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CTP1P38152 299 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YHR202WP38887 602 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YAT2P40017 923 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YNL195CP40168 261 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W RGI2P40188 164 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W GTT1P40582 234 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YFR018CP43599 363 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W RPE1P46969 238 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W PMT3P47190 753 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YGL204CP53089 101 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W TWF1P53250 332 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ZPR1P53303 486 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CAF40P53829 373 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W PRM1P53835 661 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W MRPL19P53875 158 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W EOS1P53938 366 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YDR476CQ03362 224 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YDR249CQ03787 373 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CSN9Q03981 162 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data3.33□□□□□ -1.88not detected
VFA1YER128W ZEO1Q08245 113 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W FEX1Q08913 375 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SRO7Q12038 1033 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W LEU9Q12166 604 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W RKI1Q12189 258 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W VAM3Q12241 283 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SKS1Q12505 502 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W PNO1Q99216 274 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W LYS2P07702 1392 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W PDR12Q02785 1511 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W KOG1P38873 1557 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SEM1O94742 89 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SAM1P10659 382 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W MTF2P10849 440 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W HPR1P17629 752 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W STE4P18851 423 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W HOP1P20050 605 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SLY1P22213 666 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W GSY1P23337 708 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W MIH1P23748 554 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W MNE1P24720 663 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W GEX1P25596 615 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CPR3P25719 182 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CMK1P27466 446 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data3.32□□□□□ -1.88not detected
VFA1YER128W PET309P32522 965 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W TCA17P32613 152 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W AST1P35183 429 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W TAF14P35189 244 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YKR051WP36142 418 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W LAS1P36146 502 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SCO2P38072 301 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W TRM5P38793 499 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SPC97P38863 823 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W NVJ1P38881 321 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SSP120P39931 234 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W GDI1P39958 451 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W RGI1P40043 161 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YJL068CP40363 299 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YIL089WP40500 205 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W TFG2P41896 400 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W MIC19P43594 170 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W IRC6P43615 237 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YJL016WP47072 561 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YJR120WP47157 116 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W IBA57P47158 497 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YJR154WP47181 346 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W PUS4P48567 403 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ORC5P50874 479 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W TAF6P53040 516 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W COG1P53079 417 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W DBP6P53734 629 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ADE16P54113 591 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W DID2P69771 204 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ARL3Q02804 198 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W NGL3Q03210 505 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W NGL2Q03264 515 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W PEX12Q04370 399 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W PLM2Q04383 521 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SOV1Q04748 898 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SDO1Q07953 250 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W REX4Q08237 289 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W TRE2Q08693 809 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W TGS1Q12052 315 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W RUP1Q12242 671 aa3.32□□□□□ -1.88
VFA1YER128W HER1Q12276 1246 aa3.32□□□□□ -1.88
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