RNA–Protein interactions for RNA: YDR297W

SUR2, Transcript of Sphinganine C4-hydroxylase, yeast

Gene SUR2, Length 1,050 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SUR2	YDR297W	MRX6	P48564	524 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	LYS5	P50113	272 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	ORC5	P50874	479 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	YGR111W	P53265	400 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SLI1	P53304	468 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	MAL12	P53341	584 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	YSA1	Q01976	231 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	URH1	Q04179	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	BCH1	Q05029	724 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	THI7	Q05998	598 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	REX4	Q08237	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	MUM3	Q08750	479 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	UPC2	Q12151	913 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SEY1	Q99287	776 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	CDC8	P00572	216 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	GAL4	P04386	881 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	MAS2	P11914	482 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	POX1	P13711	748 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	CDC23	P16522	626 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	CBF1	P17106	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	APA2	P22108	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	YCK1	P23291	538 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	DAL2	P25335	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	YCR051W	P25631	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	MRP20	P32387	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	MAC1	P35192	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	KKQ8	P36004	724 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SEN34	P39707	275 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	GID8	P40208	455 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	CHS6	P40955	746 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	CPR7	P47103	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	ILM1	P47155	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	IBA57	P47158	497 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	GLO1	P50107	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	MRK1	P50873	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SCS3	P53012	380 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	COG1	P53079	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	YGR035C	P53222	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SDH1	Q00711	640 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	PPM1	Q04081	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SNA4	Q07549	140 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	RTR2	Q12378	196 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	LAA1	P39526	2014 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SNA3	P14359	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	CTR86	P25355	563 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	IMG1	P25626	169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	CSG2	P35206	410 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	STB6	P36085	766 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	AGP2	P38090	596 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	YBR259W	P38338	688 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	MUP3	P38734	546 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	YHR078W	P38799	552 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	CEM1	P39525	442 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	NUP60	P39705	539 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	RGI2	P40188	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	ASG1	P40467	964 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	FMC1	P40491	155 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SNL1	P40548	159 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	IRC24	P40580	263 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	BUD8	P41698	603 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	MIC19	P43594	170 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	YJR056C	P47115	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	ALT2	P52892	507 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	TIM21	P53220	239 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	DIA1	P54005	336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	CTF19	Q02732	369 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	STP4	Q07351	490 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SHS1	Q07657	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	PNS1	Q12412	539 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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