RNA–Protein interactions for RNA: YCL043C

PDI1, Transcript of Protein disulfide isomerase, yeast

Gene PDI1, Length 1,569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDI1	YCL043C	SKM1	Q12469	655 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	SIR3	P06701	978 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	FUS1	P11710	512 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	MRPL33	P20084	86 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	RBK1	P25332	333 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	DCC1	P25559	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	PEX34	P25584	144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	YCR099C	P25657	155 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	YBL029W	P38201	376 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	FTH1	P38310	465 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	YHR045W	P38775	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	DUN1	P39009	513 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	HAT2	P39984	401 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	RGI2	P40188	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	SOK1	P40317	901 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	KEL2	P50090	882 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	AIF1	P52923	378 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	CAF40	P53829	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	YNL034W	P53963	612 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	EFM6	P53970	246 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	YNL018C	P53976	612 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	SDH1	Q00711	640 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	PML39	Q03760	334 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	DAL4	Q04895	635 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	ISU2	Q12056	156 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	UBX3	Q12229	455 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	YOL107W	Q12239	342 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	RBD2	Q12270	262 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	MDY2	Q12285	212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	YPL247C	Q12523	523 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDI1	YCL043C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	PMT2	P31382	759 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	KAP122	P32767	1081 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	TOD6	P34219	525 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	CTF13	P35203	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	VRP1	P37370	817 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	SAF1	P38352	637 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	RIM11	P38615	370 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	LEU5	P38702	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MUP3	P38734	546 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MSS4	P38994	779 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YAR028W	P39548	234 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MIT1	P40002	666 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	PRM2	P40534	656 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YIR007W	P40566	764 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	ARH1	P48360	493 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	UBC12	P52491	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MAL11	P53048	616 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	TPN1	P53099	579 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	SPP2	Q02521	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	SCS7	Q03529	384 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	RAD33	Q04231	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	CRN1	Q06440	651 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	UAF30	Q08747	228 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	NUS1	Q12063	375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YLR046C	Q12253	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	TMA17	Q12513	150 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	SPS1	P08458	490 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	GAL3	P13045	520 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	GEX1	P25596	615 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	FUN30	P31380	1131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	SFP1	P32432	683 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	PTM1	P32857	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	DUT1	P33317	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	GEX2	P36173	615 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MBA1	P38300	278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	BIG1	P38813	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	ACO2	P39533	789 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	GIP4	P39732	760 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	PCL6	P40038	420 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	ALG8	P40351	577 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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