RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRVP-205ENST00000641549 USP32Q8NFA0 1604 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRVP-205ENST00000641549 PASKQ96RG2 1323 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRVP-205ENST00000641549 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRVP-205ENST00000641549 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 USP17L5A8MUK1 530 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 RASSF7Q02833 373 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 REREQ9P2R6 1566 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 GOLGA8KD6RF30 607 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 HSPA6P17066 643 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC12A2P55011 1212 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 PDXDC2PQ6P474 469 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 PPFIBP2Q8ND30 876 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 KRT12Q99456 494 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 MEIS1O00470 390 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 GPSM2P81274 684 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 BFSP1Q12934 665 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 POTEDQ86YR6 584 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC10A4Q96EP9 437 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM167AQ96KS9 214 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 MED7O43513 233 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 MXI1P50539 228 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 NDST4Q9H3R1 872 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 CSF1RP07333 972 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 CDC25AP30304 524 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 ARHGAP25P42331 645 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 PROM2Q8N271 834 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 TCP11Q8WWU5 503 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 DIP2AQ14689 1571 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 SERPING1P05155 500 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 OAS2P29728 719 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 SARM1Q6SZW1 724 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 STMN2Q93045 179 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 HSPA1LP34931 641 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 DDIT3P35638 169 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 EHHADHQ08426 723 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 BARGINQ6ZT62 677 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 ARHGAP24Q8N264 748 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 CEP95Q96GE4 821 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 GCNT4Q9P109 453 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 PIK3C2BO00750 1634 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 SNAP23O00161 211 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 KCNQ2O43526 872 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 BARHL2Q9NY43 387 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 CLIC2O15247 247 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 ATF2P15336 505 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 GABPAQ06546 454 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 MTERF2Q49AM1 385 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 CABS1Q96KC9 395 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 A6NJR5 290 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 RNF40O75150 1001 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 MED4Q9NPJ6 270 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 TECPR2O15040 1411 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 KRT76Q01546 638 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC35F6Q8N357 371 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF653Q96CK0 615 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 BPIFA3Q9BQP9 254 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 PRELPP51888 382 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 STXBP2Q15833 593 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 METTL23Q86XA0 190 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF148Q9UQR1 794 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 PBKQ96KB5 322 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 WDR64B1ANS9 1081 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 USP17L10C9JJH3 530 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.2 ms