RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	FUT4	P22083	530 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	ABHD8	Q96I13	439 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	COG3	Q96JB2	828 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	MAML3	Q96JK9	1138 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	CATSPER2	Q96P56	530 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	TSG101	Q99816	390 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	NOD2	Q9HC29	1040 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM50B	Q9Y247	325 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	IPP	Q9Y573	584 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF202	O95125	648 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM11	P17152	192 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	MAPK9	P45984	424 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	NLRP5	P59047	1200 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	DRP2	Q13474	957 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	DPYS	Q14117	519 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	IPMK	Q8NFU5	416 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	GDAP1	Q8TB36	358 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	NES	P48681	1621 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	LACTBL1	A8MY62	500 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	CETN3	O15182	167 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	SNX4	O95219	450 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	SPDYE6	P0CI01	402 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	LIMK1	P53667	647 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	CAMK2B	Q13554	666 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	RASIP1	Q5U651	963 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	PPM1N	Q8N819	430 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	TMCO1	Q9UM00	188 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	ERCC6	Q03468	1493 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	N4BP3	O15049	544 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	CYP27B1	O15528	508 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	FLOT1	O75955	427 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	YEATS4	O95619	227 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	LINGO3	P0C6S8	592 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	ETFB	P38117	255 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	C21orf58	P58505	322 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	BLMH	Q13867	455 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	TRIM14	Q14142	442 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	KRT71	Q3SY84	523 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	TTC8	Q8TAM2	541 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	RELT	Q969Z4	430 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	NLRP4	Q96MN2	994 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	NDN	Q99608	321 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	MALT1	Q9UDY8	824 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	MTSS1	O43312	755 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	UPP2	O95045	317 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NECAP1-222	ENST00000640072	PLCG2	P16885	1265 aa		6.67	□□□□□ -1.34

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