RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 BANK1Q8NDB2 785 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 ISCUQ9H1K1 167 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 CDR1P51861 262 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 TBC1D5Q92609 795 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 SEC16BQ96JE7 1060 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 MYH4Q9Y623 1939 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 A0A087X0T9 212 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 FAM228BP0C875 321 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 PPP1R2P41236 205 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 ARID5AQ03989 594 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 PNMA1Q8ND90 353 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 AK8Q96MA6 479 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 SCLT1Q96NL6 688 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 CPVLQ9H3G5 476 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 LAD1O00515 517 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 NF2P35240 595 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 E2F5Q15329 346 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 CHADLQ6NUI6 762 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 SCTRP47872 440 aa22.52■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.52■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 RAPGEF5Q92565 580 aa22.52■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 SGSM3Q96HU1 749 aa22.52■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.52■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 EP400Q96L91 3159 aa22.52■■□□□ 1.2
PMS1-222ENST00000639501 TNNC1P63316 161 aa22.52■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 GRB10Q13322 594 aa22.52■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.52■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.52■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa22.52■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 KCNK3O14649 394 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 SERPING1P05155 500 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 MIEF2Q96C03 454 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 AP1M1Q9BXS5 423 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 BARHL2Q9NY43 387 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 ABCB11O95342 1321 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 CEP72Q9P209 647 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 C5orf60A6NFR6 353 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 PPP2R2AP63151 447 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 AMPD3Q01432 767 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 SLC18A3Q16572 532 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 UNC13DQ70J99 1090 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 VEZTQ9HBM0 779 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 TAF1P21675 1872 aa22.49■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.49■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 TATDN2Q93075 761 aa22.49■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 PNMA5Q96PV4 448 aa22.49■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 TFAP4Q01664 338 aa22.49■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 GRM4Q14833 912 aa22.49■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 SV2BQ7L1I2 683 aa22.49■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.49■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.49■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.48■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 BCL9O00512 1426 aa22.48■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 USP17L8P0C7I0 530 aa22.48■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 MECOMQ03112 1051 aa22.48■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.48■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 ODF2Q5BJF6 829 aa22.48■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa22.48■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 KIRREL3Q8IZU9 778 aa22.48■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 SCN7AQ01118 1682 aa22.48■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 USP17L3A6NCW0 530 aa22.48■■□□□ 1.19
PMS1-222ENST00000639501 USP17L4A6NCW7 530 aa22.48■■□□□ 1.19
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