RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638075.1

EFHC1-238, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 4

Gene EFHC1, Length 540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-238	ENST00000638075		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	VCAN	P13611	3396 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	ZBBX	A8MT70	800 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	ATP9A	O75110	1047 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	CXCL10	P02778	98 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	LGALS2	P05162	132 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	FOSL2	P15408	326 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	CDC27	P30260	824 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	RABGGTB	P53611	331 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	UBE2S	Q16763	222 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	RTN1	Q16799	776 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	NLRX1	Q86UT6	975 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	SERINC5	Q86VE9	423 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	FBXL16	Q8N461	479 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	WNT8B	Q93098	351 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	GPRASP2	Q96D09	838 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	MAFG	O15525	162 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	NBN	O60934	754 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	BAIAP3	O94812	1187 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	CPA1	P15085	419 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	MYOG	P15173	224 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	KCNA2	P16389	499 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	11.66	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	CDHR1	Q96JP9	859 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	STXBP3	O00186	592 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	DLL1	O00548	723 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	REC8	O95072	547 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	ADAM17	P78536	824 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	MBTPS1	Q14703	1052 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075		Q6ZUG5	572 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	SLC9A7	Q96T83	725 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	JADE2	Q9NQC1	790 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	BARHL2	Q9NY43	387 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	KAT6A	Q92794	2004 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	SMCO2	A6NFE2	343 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	TREH	O43280	583 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	NAPA	P54920	295 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	EVC	P57679	992 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	FGD1	P98174	961 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	APOBR	Q0VD83	1088 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	MTMR1	Q13613	665 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	ADGRE1	Q14246	886 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	TCTN1	Q2MV58	587 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	BRF1	Q92994	677 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		11.64	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	PTPRS	Q13332	1948 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	RSPH10B	P0C881	870 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	GNAT1	P11488	350 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	RPS6KB1	P23443	525 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	THPO	P40225	353 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-238	ENST00000638075	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55

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