RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637887.1

ARID1B-231, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5

Gene ARID1B, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-231	ENST00000637887		K7ESM1	405 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	ADRB1	P08588	477 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	MAP4K2	Q12851	820 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	CHRNA2	Q15822	529 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	SPATS1	Q496A3	300 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	EMC4	Q5J8M3	183 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	CDIP1	Q9H305	208 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	KLF4	O43474	513 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	DGKI	O75912	1065 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	USP53	Q70EK8	1073 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	GGN	Q86UU5	652 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	GML	Q99445	158 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	JAM3	Q9BX67	310 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	DTL	Q9NZJ0	730 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	TOPBP1	Q92547	1522 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	TEPP	Q6URK8	271 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	GPR27	Q9NS67	375 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	ARAP1	Q96P48	1450 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	MROH6	A6NGR9	719 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	LRG1	P02750	347 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	MYOT	Q9UBF9	498 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	WASF3	Q9UPY6	502 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	ITGB3	P05106	788 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	INVS	Q9Y283	1065 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARID1B-231	ENST00000637887	PRODH	O43272	600 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF28	P17035	718 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	SGSM3	Q96HU1	749 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	WDR97	A6NE52	1622 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	SLC27A2	O14975	620 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	NTRK3	Q16288	839 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	LGI4	Q8N135	537 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	OSBP2	Q969R2	916 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	CROT	Q9UKG9	612 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	BLACE	A4D250	179 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	IL13	P35225	146 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	GRIN1	Q05586	938 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF827	Q17R98	1081 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	FAM124A	Q86V42	546 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	CLIC6	Q96NY7	704 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	KRIT1	O00522	736 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	PLAT	P00750	562 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	COL6A2	P12110	1019 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	RAB33A	Q14088	237 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	BORA	Q6PGQ7	559 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	DCAF4	Q8WV16	495 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	KCNJ15	Q99712	375 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	MAFK	O60675	156 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	FGFR1	P11362	822 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	INSRR	P14616	1297 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22

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