RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	SESTD1	Q86VW0	696 aa		18.93	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		18.93	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		18.93	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		18.93	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		18.93	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		18.93	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		18.92	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035		H3BRB1	525 aa		18.92	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	DEXI	O95424	95 aa		18.92	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	ACR	P10323	421 aa		18.92	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	EPHB4	P54760	987 aa		18.92	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPR20	Q99678	358 aa		18.92	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		18.92	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	IL23A	Q9NPF7	189 aa		18.92	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		18.92	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		18.92	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATP9A	O75110	1047 aa		18.91	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	LGALS2	P05162	132 aa		18.91	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	SREBF1	P36956	1147 aa		18.91	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	NEK4	P51957	841 aa		18.91	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	CEP55	Q53EZ4	464 aa		18.91	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		18.91	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	SDF4	Q9BRK5	362 aa		18.91	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		18.91	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		18.91	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		18.91	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		18.9	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	HAS3	O00219	553 aa		18.9	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	SEC24B	O95487	1268 aa		18.9	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	FGB	P02675	491 aa		18.9	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCNA2	P16389	499 aa		18.9	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	AK2	P54819	239 aa		18.9	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARHGAP4	P98171	946 aa		18.9	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPR153	Q6NV75	609 aa		18.9	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF365	Q70YC5	407 aa		18.9	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	18.9	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		18.9	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		18.9	■□□□□ 0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	PITPNM1	O00562	1244 aa		18.89	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	GNAT1	P11488	350 aa		18.89	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	XBP1	P17861	261 aa		18.89	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM240	Q5SV17	173 aa		18.89	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	CAGE1	Q8TC20	777 aa		18.89	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	SCLY	Q96I15	445 aa		18.89	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		18.89	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		18.88	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		18.88	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	PFKFB2	O60825	505 aa		18.88	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	PFKM	P08237	780 aa		18.88	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	SCRN1	Q12765	414 aa		18.88	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		18.88	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		18.88	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	GLG1	Q92896	1179 aa		18.88	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		18.88	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	MEIS1	O00470	390 aa		18.87	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYP3A4	P08684	503 aa		18.87	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	IQCF3	P0C7M6	154 aa		18.87	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	AR	P10275	920 aa		18.87	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	RFC2	P35250	354 aa		18.87	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTK7	Q13308	1070 aa		18.87	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		18.87	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		18.87	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		18.87	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		18.87	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		18.87	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		18.87	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	18.87	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	AZI2	Q9H6S1	392 aa		18.87	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	NFASC	O94856	1347 aa		18.86	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		18.86	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		18.86	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	ACTN1	P12814	892 aa		18.86	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	GALNT17	Q6IS24	598 aa		18.86	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		18.86	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	DEFB123	Q8N688	67 aa		18.86	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		18.86	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	WASF1	Q92558	559 aa		18.86	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	IL17RA	Q96F46	866 aa		18.86	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		18.86	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		18.86	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		18.86	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		18.86	■□□□□ 0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		18.85	■□□□□ 0.61

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