RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 EML1O00423 815 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 BIN1O00499 593 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 MED24O75448 989 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 SMC2O95347 1197 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 CAVIN2O95810 425 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 FCER1AP12319 257 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 NLRX1Q86UT6 975 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF214Q8ND24 703 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJC25Q9H1X3 360 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 RGS20O76081 388 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 MYL1P05976 194 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 EDNRBP24530 442 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 RPA1P27694 616 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 CASP1P29466 404 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 STXBP2Q15833 593 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM110CQ1W6H9 321 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 UNC45AQ9H3U1 944 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D22BQ9NU19 505 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 MAN1B1Q9UKM7 699 aa27.92■■■□□ 2.06
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CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 CUL4BQ13620 913 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR78Q5VTH9 848 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNK18Q7Z418 384 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 CATSPER3Q86XQ3 398 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM200AQ8TCP9 573 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 RAD54LQ92698 747 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
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CAPNS1-215ENST00000628018 SEMA3FQ13275 785 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 DPCR1Q3MIW9 517 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIML1Q8N9V2 468 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
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CAPNS1-215ENST00000628018 GSDMAQ96QA5 445 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 BLZF1Q9H2G9 400 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 PKD2L1Q9P0L9 805 aa27.91■■■□□ 2.06
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CAPNS1-215ENST00000628018 PGK2P07205 417 aa27.9■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 MORC3Q14149 939 aa27.9■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 ISM2Q6H9L7 571 aa27.9■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 POTEBQ6S5H4 581 aa27.9■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 IFNL1Q8IU54 200 aa27.9■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 HSD17B14Q9BPX1 270 aa27.9■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1024Q9UPX6 916 aa27.9■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 CHMP2AO43633 222 aa27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP27.89■■■□□ 2.06
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CAPNS1-215ENST00000628018 CDHR1Q96JP9 859 aa27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC37A2A6NM11 1700 aa27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa27.89■■■□□ 2.05
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CAPNS1-215ENST00000628018 AMPD3Q01432 767 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-215ENST00000628018 EPHA7Q15375 998 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-215ENST00000628018 KCTD17Q8N5Z5 321 aa27.88■■■□□ 2.05
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CAPNS1-215ENST00000628018 TUFT1Q9NNX1 390 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-215ENST00000628018 B4DLN1 442 aa27.87■■■□□ 2.05
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CAPNS1-215ENST00000628018 STRNO43815 780 aa27.87■■■□□ 2.05
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CAPNS1-215ENST00000628018 SREBF2Q12772 1141 aa27.87■■■□□ 2.05
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CAPNS1-215ENST00000628018 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
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CAPNS1-215ENST00000628018 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa27.87■■■□□ 2.05
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CAPNS1-215ENST00000628018 TM4SF4P48230 202 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP4A11Q02928 519 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-215ENST00000628018 UVSSAQ2YD98 709 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-215ENST00000628018 DYDC2Q96IM9 177 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-215ENST00000628018 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-215ENST00000628018 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-215ENST00000628018 MIER3Q7Z3K6 550 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-215ENST00000628018 NEK9Q8TD19 979 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-215ENST00000628018 MORC4Q8TE76 937 aa27.85■■■□□ 2.05
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