RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 CRYGNQ8WXF5 182 aa28.43■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 NOP56O00567 594 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 ADAMTS3O15072 1205 aa28.42■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 ATP9AO75110 1047 aa28.42■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 ARHGAP4P98171 946 aa28.42■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 FPGSQ05932 587 aa28.42■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 CEP55Q53EZ4 464 aa28.42■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 GPR20Q99678 358 aa28.42■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 PSEN2P49810 448 aa28.41■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 MFSD10Q14728 455 aa28.41■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 LRIT3Q3SXY7 679 aa28.41■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 C16orf70Q9BSU1 422 aa28.41■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 HIPK3Q9H422 1215 aa28.41■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 KCNH7Q9NS40 1196 aa28.41■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 STK36Q9NRP7 1315 aa28.41■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 CYP3A4P08684 503 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 KIAA0753Q2KHM9 967 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 CYP2W1Q8TAV3 490 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 MEIS1O00470 390 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 LGALS2P05162 132 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 CHMP4BP1P59074 171 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 ME3Q16798 604 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 NIPA1Q7RTP0 329 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 TMEM199Q8N511 208 aa28.39■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 GTF3C6Q969F1 213 aa28.39■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 TANC1Q9C0D5 1861 aa28.38■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 CYP2C18P33260 490 aa28.38■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 NLRP5P59047 1200 aa28.38■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 C7orf31Q8N865 590 aa28.38■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 KIF2CQ99661 725 aa28.38■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 ALG1Q9BT22 464 aa28.38■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 HDAC6Q9UBN7 1215 aa28.38■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 UMODL1Q5DID0 1318 aa28.37■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 H3BRB1 525 aa28.37■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 LARGE1O95461 756 aa28.37■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 CTDNEP1O95476 244 aa28.37■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 CYP2C9P11712 490 aa28.37■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 RBM25P49756 843 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 EPHB4P54760 987 aa28.37■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.132e-6■■□□□ 12.6
PMS1-220ENST00000618056 SHHQ15465 462 aa28.37■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 GALNT17Q6IS24 598 aa28.37■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 RASGRP4Q8TDF6 673 aa28.37■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 AIFM3Q96NN9 605 aa28.37■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.37■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 PCDHA4Q9UN74 947 aa28.37■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 NFASCO94856 1347 aa28.36■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 ZNF76P36508 570 aa28.36■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 PTGISQ16647 500 aa28.36■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 C9orf50Q5SZB4 431 aa28.36■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 DAGLBQ8NCG7 672 aa28.36■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 CTAGE1Q96RT6 745 aa28.36■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 TELO2Q9Y4R8 837 aa28.36■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 SCN5AQ14524 2016 aa28.36■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa28.35■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 ARP10275 920 aa28.35■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 CSF2RAP15509 400 aa28.35■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 WNT8AQ9H1J5 351 aa28.35■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 PKD2L1Q9P0L9 805 aa28.35■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 NOD1Q9Y239 953 aa28.35■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 FAM86B1E9PN63 330 aa28.34■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 PITPNM1O00562 1244 aa28.34■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 FAM86B2P0C5J1 330 aa28.34■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 SP4Q02446 784 aa28.34■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 NPY5RQ15761 445 aa28.34■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 NECAB1Q8N987 351 aa28.34■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 SEPT1Q8WYJ6 367 aa28.34■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 M0R2N6 131 aa28.34■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 CIITAP33076 1130 aa28.34■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 BLIDQ8IZY5 108 aa28.34■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 SDF4Q9BRK5 362 aa28.34■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 SLC9A2Q9UBY0 812 aa28.34■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa28.33■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 HOXC8P31273 242 aa28.33■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 BFSP2Q13515 415 aa28.33■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 PLA2G4DQ86XP0 818 aa28.33■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 WASF1Q92558 559 aa28.33■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa28.33■■■□□ 2.13
PMS1-220ENST00000618056 WDR81Q562E7 1941 aa28.32■■■□□ 2.12
PMS1-220ENST00000618056 XBP1P17861 261 aa28.32■■■□□ 2.12
PMS1-220ENST00000618056 CCL23P55773 120 aa28.32■■■□□ 2.12
PMS1-220ENST00000618056 SETQ01105 290 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
PMS1-220ENST00000618056 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
PMS1-220ENST00000618056 C16orf59Q7L2K0 433 aa28.32■■■□□ 2.12
PMS1-220ENST00000618056 TET1Q8NFU7 2136 aa28.32■■■□□ 2.12
PMS1-220ENST00000618056 CAGE1Q8TC20 777 aa28.32■■■□□ 2.12
PMS1-220ENST00000618056 PHF20Q9BVI0 1012 aa28.32■■■□□ 2.12
PMS1-220ENST00000618056 IL23AQ9NPF7 189 aa28.32■■■□□ 2.12
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