RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597360.5

PDE4C-211, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4C, Length 3,511 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-211ENST00000597360 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 NQO1P15559 274 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 TRAF1Q13077 416 aa16.87■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 UBE4AQ14139 1066 aa16.87■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa16.87■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa16.87■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa16.87■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 SYNE4Q8N205 404 aa16.87■□□□□ 0.29
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PDE4C-211ENST00000597360 ZNF570Q96NI8 536 aa16.87■□□□□ 0.29
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PDE4C-211ENST00000597360 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa16.87■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 DISC1Q9NRI5 854 aa16.87■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 KLHL33A6NCF5 533 aa16.86■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 RAD23BP54727 409 aa16.86■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 INF2Q27J81 1249 aa16.86■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 MUM1Q2TAK8 710 aa16.86■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 PDXDC2PQ6P474 469 aa16.86■□□□□ 0.29
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PDE4C-211ENST00000597360 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 LAMB3Q13751 1172 aa16.86■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 VWA3BQ502W6 1294 aa16.86■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16.86■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 FMO2Q99518 471 aa16.86■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 GBP1P32455 592 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 LETM2Q2VYF4 491 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 ETNK1Q9HBU6 452 aa16.85■□□□□ 0.29
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PDE4C-211ENST00000597360 RNF14Q9UBS8 474 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 SNX24Q9Y343 169 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 PRLRP16471 622 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 NELFCDQ8IXH7 590 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 USP38Q8NB14 1042 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 RUBCNQ92622 972 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 P3H4Q92791 437 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 ISCUQ9H1K1 167 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 NEUROG2Q9H2A3 272 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa16.85■□□□□ 0.29
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PDE4C-211ENST00000597360 ITGA4P13612 1032 aa16.84■□□□□ 0.29
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PDE4C-211ENST00000597360 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 GGA2Q9UJY4 613 aa16.84■□□□□ 0.29
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PDE4C-211ENST00000597360 SMIM22K7EJ46 135 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 SUN1O94901 812 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 CYP7A1P22680 504 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 CUL1Q13616 776 aa16.84■□□□□ 0.29
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PDE4C-211ENST00000597360 TSG101Q99816 390 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
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PDE4C-211ENST00000597360 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 RGPD1P0DJD0 1748 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 WDR17Q8IZU2 1322 aa16.84■□□□□ 0.29
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PDE4C-211ENST00000597360 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 PYGLP06737 847 aa16.84■□□□□ 0.29
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PDE4C-211ENST00000597360 ITIH3Q06033 890 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
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PDE4C-211ENST00000597360 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 AGAP1Q9UPQ3 857 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 H7C1W4 665 aa16.83■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 STXBP3O00186 592 aa16.83■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 PPIP5K2O43314 1243 aa16.83■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 PLCG1P19174 1290 aa16.83■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 ATP4AP20648 1035 aa16.83■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 TMEM154Q6P9G4 183 aa16.83■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 TRIM7Q9C029 511 aa16.83■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16.83■□□□□ 0.29
PDE4C-211ENST00000597360 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 TCP11X1B4DZS4 312 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 KRT16P08779 473 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 RPS6KA3P51812 740 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
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