RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 H7C1D1 291 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 CELF2O95319 508 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 DAB2P98082 770 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 CHRNDQ07001 517 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 SLFN5Q08AF3 891 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 PSMD2Q13200 908 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 FYB2Q5VWT5 728 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 ANKRD44Q8N8A2 993 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 RNF214Q8ND24 703 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 GIPC2Q8TF65 315 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 SUCLG2Q96I99 432 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 CHMP4AQ9BY43 222 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 SSC5DA1L4H1 1573 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 GRM8O00222 908 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 TAF5LO75529 589 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 CTSHP09668 335 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 LBX1P52954 281 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 ERVK-24P63145 666 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 AGBL3Q8NEM8 1001 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 ASB11Q8WXH4 323 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 CDCA5Q96FF9 252 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 MYH16Q9H6N6 1097 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 CD209Q9NNX6 404 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 GGA3Q9NZ52 723 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 CSADQ9Y600 493 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 OTOFQ9HC10 1997 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 WNT10BO00744 389 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 ALDH1L1O75891 902 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 IL1R1P14778 569 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 NME2P22392 152 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 CFPP27918 469 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 NTF4P34130 210 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 PPM1JQ5JR12 505 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 STRIP1Q5VSL9 837 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 MOB2Q70IA6 237 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 FRMD6Q96NE9 622 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 COA1Q9GZY4 146 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 CBX8Q9HC52 389 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 ERCC3P19447 782 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 BMP6P22004 513 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 ARNTP27540 789 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 MAP2K2P36507 400 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 RAP1GAPP47736 663 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 HUNKP57058 714 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 C1QL4Q86Z23 238 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 CEP44Q9C0F1 390 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 USP44Q9H0E7 712 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 MYH13Q9UKX3 1938 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 SASH1O94885 1247 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 MAP3K11Q16584 847 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 LRRC24Q50LG9 513 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 RGMBQ6NW40 437 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-212ENST00000597259 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms