RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 ASIC1P78348 528 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 IQCB1Q15051 598 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 CCL15Q16663 113 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 NAALADL2Q58DX5 795 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R9BQ96SB3 815 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 PLIN2Q99541 437 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 COL20A1Q9P218 1284 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMD10O75832 226 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF20AO95235 890 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 SFNP31947 248 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 KCTD2Q14681 263 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 EPHA7Q15375 998 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 STXBP2Q15833 593 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 VSIG10LQ86VR7 867 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 RDM1Q8NG50 284 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 PNMA5Q96PV4 448 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 VAV3Q9UKW4 847 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA1024Q9UPX6 916 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 TPM3P06753 285 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 JAK3P52333 1124 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT76Q01546 638 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMD2Q13200 908 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 CUL4BQ13620 913 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 SPRYD7Q5W111 196 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 ISM2Q6H9L7 571 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM9Q9C026 710 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 RHOBTB3O94955 611 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 SPIRE1Q08AE8 756 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 SARM1Q6SZW1 724 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC65Q8IXS2 484 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 BLZF1Q9H2G9 400 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 BTBD7Q9P203 1132 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMA7O14818 248 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 CBFA2T2O43439 604 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 ITGB5P18084 799 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 LBX1P52954 281 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 MOGSQ13724 837 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 UNC13DQ70J99 1090 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 MIER3Q7Z3K6 550 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 NACC1Q96RE7 527 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM5Q9C035 493 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-212ENST00000591041 SMCHD1A6NHR9 2005 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 PDHXO00330 501 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 ADCY5O95622 1261 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 PTMAP06454 111 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 PLA2G4BP0C869 781 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 ARP10275 920 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 FCER1AP12319 257 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 HUNKP57058 714 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 MCM6Q14566 821 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 STAMQ92783 540 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 ERCC3P19447 782 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 GJA5P36382 358 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 INHBEP58166 350 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 PDE4DQ08499 809 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNV1Q6PIU1 500 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 CATSPER3Q86XQ3 398 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 MMP19Q99542 508 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 WBP1LQ9NX94 342 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 KCND2Q9NZV8 630 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 POTEB3A0JP26 581 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 BICDL2A1A5D9 508 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR64B1ANS9 1081 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 EYA4O95677 639 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 ERVK-9P63128 1117 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 ERVK-24P63145 666 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 KMT5BQ4FZB7 885 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 HS1BP3Q53T59 392 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 POTEBQ6S5H4 581 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 PDLIM2Q96JY6 352 aa25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms