RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588559.5

PTPRH-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRH, Length 2,636 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-207ENST00000588559 SMTNP53814 917 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 ISCUQ9H1K1 167 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 KLC4Q9NSK0 619 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 GGA2Q9UJY4 613 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 GNA11P29992 359 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 CALCRLQ16602 461 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 TMEM260Q9NX78 707 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 BTG4Q9NY30 223 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 LAMB2P55268 1798 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 POTEMA6NI47 508 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 TRAF5O00463 557 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 KCNK3O14649 394 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 ATP6V1AP38606 617 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 KCNK18Q7Z418 384 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 RAD54LQ92698 747 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 TAF4BQ92750 862 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 NUDT12Q9BQG2 462 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 LRIG3Q6UXM1 1119 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 MTMR9Q96QG7 549 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 ABCA3Q99758 1704 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 H0YGN5 161 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 RASSF9O75901 435 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 KLHL30Q0D2K2 578 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 PLCB4Q15147 1175 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 ZCWPW2Q504Y3 356 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 SOGA3Q5TF21 947 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 PROM2Q8N271 834 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 GOLPH3Q9H4A6 298 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 NFS1Q9Y697 457 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRH-207ENST00000588559 CHUKO15111 745 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 SLC37A4O43826 429 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 RPS6KA1Q15418 735 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 SLC40A1Q9NP59 571 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 GMNCA6NCL1 334 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 ZNF844Q08AG5 666 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 PTPROQ16827 1216 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 CCDC121Q6ZUS5 278 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 SNX29Q8TEQ0 813 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 TMOD1P28289 359 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP21.07■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 CUL1Q13616 776 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 SPRED3Q2MJR0 410 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.965e-12■■■■■ 104.3
PTPRH-207ENST00000588559 NEUROG2Q9H2A3 272 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 TDP2O95551 362 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 CCDC172P0C7W6 258 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 RDXP35241 583 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 COASYQ13057 564 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 PSMD2Q13200 908 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 DRP2Q13474 957 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 QPCTQ16769 361 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 TMEM266Q2M3C6 531 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 CCDC114Q96M63 670 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 AP1M1Q9BXS5 423 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 BACH1O14867 736 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 TRAPPC3O43617 180 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 CEP104O60308 925 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 ASIC2Q16515 512 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 LRRC45Q96CN5 670 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 PIGSQ96S52 555 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 TBC1D7Q9P0N9 293 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.05■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 KIF4AO95239 1232 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 SCFD2Q8WU76 684 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRH-207ENST00000588559 OSBPL7Q9BZF2 842 aa21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms