RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 ERMNQ8TAM6 284 aa29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 HHIPL1Q96JK4 782 aa29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 MMP19Q99542 508 aa29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 TEKT3Q9BXF9 490 aa29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 STK24Q9Y6E0 443 aa29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 LRRC37A2A6NM11 1700 aa29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 ADGRA2Q96PE1 1338 aa29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 FSTL1Q12841 308 aa29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 SEMA3FQ13275 785 aa29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 CUL4BQ13620 913 aa29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 KCTD2Q14681 263 aa29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 DPCR1Q3MIW9 517 aa29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM200AQ8TCP9 573 aa29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 FGD4Q96M96 766 aa29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 NT5C3AQ9H0P0 336 aa29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 UNC45AQ9H3U1 944 aa29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 MAN1B1Q9UKM7 699 aa29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 POTEB3A0JP26 581 aa29.2■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 SMC2O95347 1197 aa29.2■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP29.2■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 RPA1P27694 616 aa29.2■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 POTEBQ6S5H4 581 aa29.2■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 CATSPER3Q86XQ3 398 aa29.2■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC102AQ96A19 550 aa29.2■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 BLZF1Q9H2G9 400 aa29.2■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa29.2■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 MAFGO15525 162 aa29.19■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 CAVIN2O95810 425 aa29.19■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 PGK2P07205 417 aa29.19■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 FCER1AP12319 257 aa29.19■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 BMP6P22004 513 aa29.19■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM110CQ1W6H9 321 aa29.19■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 RAD54LQ92698 747 aa29.19■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 PKD2L1Q9P0L9 805 aa29.19■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP9AO75110 1047 aa29.18■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 MYL1P05976 194 aa29.18■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 INHBEP58166 350 aa29.18■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 STXBP2Q15833 593 aa29.18■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR78Q5VTH9 848 aa29.18■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 ISM2Q6H9L7 571 aa29.18■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 NLRX1Q86UT6 975 aa29.18■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 GSDMAQ96QA5 445 aa29.18■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 HSD17B14Q9BPX1 270 aa29.18■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 TBC1D22BQ9NU19 505 aa29.18■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 CHMP2AO43633 222 aa29.18■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 MORC3Q14149 939 aa29.18■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIML1Q8N9V2 468 aa29.18■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA1024Q9UPX6 916 aa29.18■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 PLXNB2O15031 1838 aa29.18■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 DEKP35659 375 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF165P49910 485 aa29.17■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 IFNL1Q8IU54 200 aa29.17■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 CBX8Q9HC52 389 aa29.17■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 POTEFA5A3E0 1075 aa29.16■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 MCM6Q14566 821 aa29.16■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 POTEGQ6S5H5 508 aa29.16■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 SV2BQ7L1I2 683 aa29.16■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 CDHR1Q96JP9 859 aa29.16■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM9Q9C026 710 aa29.16■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 RGL1Q9NZL6 768 aa29.16■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa29.15■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNA2P16389 499 aa29.15■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 EPHA7Q15375 998 aa29.15■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 GNPTABQ3T906 1256 aa29.15■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 C7orf25Q9BPX7 421 aa29.15■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 E9PMD0 336 aa29.14■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 CYP4A11Q02928 519 aa29.14■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 ABRAQ8N0Z2 381 aa29.14■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 TUFT1Q9NNX1 390 aa29.14■■■□□ 2.26
SCAMP4-210ENST00000588555 SLITRK3O94933 977 aa29.13■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 RPN1P04843 607 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 ICAM3P32942 547 aa29.13■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 AMPD3Q01432 767 aa29.13■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 IQCB1Q15051 598 aa29.13■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 DYDC2Q96IM9 177 aa29.13■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 KLRC4O43908 158 aa29.13■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 PDE4DQ08499 809 aa29.13■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 KCTD17Q8N5Z5 321 aa29.13■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 ZIC5Q96T25 663 aa29.13■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 MYMKA6NI61 221 aa29.12■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 STRNO43815 780 aa29.12■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 PSMC6P62333 389 aa29.12■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 SREBF2Q12772 1141 aa29.12■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 LUZP1Q86V48 1076 aa29.12■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 MORC4Q8TE76 937 aa29.12■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 BPIFA3Q9BQP9 254 aa29.12■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 CPA4Q9UI42 421 aa29.12■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 NFASCO94856 1347 aa29.11■■■□□ 2.25
SCAMP4-210ENST00000588555 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa29.11■■■□□ 2.25
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