RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 FAM86C1Q9NVL1 165 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 WHRNQ9P202 907 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 DDX19BQ9UMR2 479 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 KIF16BQ96L93 1317 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 A0A1W2PP64 1363 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 AATKQ6ZMQ8 1374 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 SHPRHQ149N8 1683 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 A2ML1A8K2U0 1454 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 RECKO95980 971 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 CD3EP07766 207 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 DBHP09172 617 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 MSL3P1P0C860 447 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 L1CAMP32004 1257 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 EIF6P56537 245 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 RIPK4P57078 832 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 GNAI1P63096 354 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 CAP1Q01518 475 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 PAK2Q13177 524 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 BECN1Q14457 450 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 NFIXQ14938 502 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 C20orf194Q5TEA3 1177 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 BICRALQ6AI39 1079 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 RCSD1Q6JBY9 416 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC81Q6ZN84 652 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 NLGN1Q8N2Q7 840 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 NLGN2Q8NFZ4 835 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 COG3Q96JB2 828 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 ZDHHC15Q96MV8 337 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 PWWP2AQ96N64 755 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 PLEKHF1Q96S99 279 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 HAUS7Q99871 368 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 GINM1Q9NU53 330 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 RTEL1Q9NZ71 1219 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 EID1Q9Y6B2 187 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 IRS2Q9Y4H2 1338 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 IQSEC2Q5JU85 1478 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 MYO5BQ9ULV0 1848 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 CBFA2T2O43439 604 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 IFNGR1P15260 489 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 MVPQ14764 893 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 GNPTABQ3T906 1256 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 EEF1DP3Q658K8 133 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 GPRASP2Q96D09 838 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 CHMP4AQ9BY43 222 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 XYLT2Q9H1B5 865 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 EFR3BQ9Y2G0 817 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-215ENST00000583289 ADAMTS20P59510 1910 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 TECPR2O15040 1411 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 ADGRB2O60241 1585 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 GIPRP48546 466 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 NCKAP1LP55160 1127 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 SLC7A5Q01650 507 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 NFE2L2Q16236 605 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 CABP7Q86V35 215 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 RASGRP4Q8TDF6 673 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 RNF38Q9H0F5 515 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 SMC4Q9NTJ3 1288 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 IFT57Q9NWB7 429 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 POLKQ9UBT6 870 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 LTBP3Q9NS15 1303 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 TNRQ92752 1358 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 NLRP1Q9C000 1473 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 KIF20BQ96Q89 1820 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 AURKAO14965 403 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 PPM1BO75688 479 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 SYN1P17600 705 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 PPP2R5DQ14738 602 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 CXorf38Q8TB03 319 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 KLHL25Q9H0H3 589 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 TBX22Q9Y458 520 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM2Q9UHN6 1383 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-215ENST00000583289 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms