RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 KAT2BQ92831 832 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 SCLYQ96I15 445 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 CDHR1Q96JP9 859 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 PGBD1Q96JS3 809 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 IL23AQ9NPF7 189 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 RIC8AQ9NPQ8 531 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 BARHL2Q9NY43 387 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-214ENST00000583153 ZBBXA8MT70 800 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 H3BRB1 525 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 STXBP3O00186 592 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 CPLX1O14810 134 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 SCG2P13521 617 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRM-214ENST00000583153 FUT2Q10981 343 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 MTMR1Q13613 665 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 METTL7BQ6UX53 244 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 C16orf59Q7L2K0 433 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 FBXL16Q8N461 479 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 PHKBQ93100 1093 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRM-214ENST00000583153 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRM-214ENST00000583153 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 C6orf50Q9HD87 102 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRM-214ENST00000583153 PTPRSQ13332 1948 aa9.51□□□□□ -0.89
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PTPRM-214ENST00000583153 SENP7Q9BQF6 1050 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.51□□□□□ -0.89
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PTPRM-214ENST00000583153 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa9.51□□□□□ -0.89
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PTPRM-214ENST00000583153 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.5□□□□□ -0.89
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PTPRM-214ENST00000583153 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 HAS3O00219 553 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 ATP9AO75110 1047 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 PFKMP08237 780 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 ACTN1P12814 892 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 GNA11P29992 359 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 RFC2P35250 354 aa9.5□□□□□ -0.89
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PTPRM-214ENST00000583153 NLRP5P59047 1200 aa9.5□□□□□ -0.89
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PTPRM-214ENST00000583153 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 CAGE1Q8TC20 777 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 SEPT1Q8WYJ6 367 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 HERVK_113Q902F9 699 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 ATP6V0A1Q93050 837 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 GPR20Q99678 358 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 MXRA8Q9BRK3 442 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 SDF4Q9BRK5 362 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 ANO3Q9BYT9 981 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 MTMR10Q9NXD2 777 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 MSRAQ9UJ68 235 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-214ENST00000583153 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa9.5□□□□□ -0.89
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