RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582821.5

GGA3-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-215ENST00000582821 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
GGA3-215ENST00000582821 SZT2Q5T011 3432 aa15.96■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 ADAMTS3O15072 1205 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 PPFIA3O75145 1194 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 CDKL5O76039 1030 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 ARHGAP4P98171 946 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.145e-7■■■□□ 18.8
GGA3-215ENST00000582821 MTMR1Q13613 665 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 MFSD10Q14728 455 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 SHHQ15465 462 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 FAM47CQ5HY64 1035 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 PGBD1Q96JS3 809 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 HIPK3Q9H422 1215 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 KCNH7Q9NS40 1196 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 VPS54Q9P1Q0 977 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 NOP56O00567 594 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 SORBS3O60504 671 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 EPHB4P54760 987 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 KIAA0753Q2KHM9 967 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 GALNT17Q6IS24 598 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 CYP2W1Q8TAV3 490 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 NFASCO94856 1347 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 STK36Q9NRP7 1315 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 H3BRB1 525 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 LGALS2P05162 132 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 ZNF286BP0CG31 522 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 CYP2C9P11712 490 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 CIITAP33076 1130 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 CYP2C18P33260 490 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 ME3Q16798 604 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 C9orf50Q5SZB4 431 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 GPR153Q6NV75 609 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 C16orf59Q7L2K0 433 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 C7orf31Q8N865 590 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 SEPT1Q8WYJ6 367 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 CTAGE1Q96RT6 745 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 PITPNM1O00562 1244 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 SLC34A2O95436 690 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 CTDNEP1O95476 244 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 ARP10275 920 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 CSF2RAP15509 400 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 RBM25P49756 843 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 NLRP5P59047 1200 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 PTGISQ16647 500 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 DAGLBQ8NCG7 672 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 KIF2CQ99661 725 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 ALG1Q9BT22 464 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 C22orf23Q9BZE7 217 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 WNT8AQ9H1J5 351 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 PCDHA4Q9UN74 947 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 UMODL1Q5DID0 1318 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 FAM86B1E9PN63 330 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 M0R2N6 131 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 FAM86B2P0C5J1 330 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 HOXC8P31273 242 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 ZNF76P36508 570 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 USP11P51784 963 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 CHMP4BP1P59074 171 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 RBL2Q08999 1139 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 BFSP2Q13515 415 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 TMEM240Q5SV17 173 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 CAGE1Q8TC20 777 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 GTF3C6Q969F1 213 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 IL23AQ9NPF7 189 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 NOD1Q9Y239 953 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 TELO2Q9Y4R8 837 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 EDIL3O43854 480 aa15.9■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 PTK7Q13308 1070 aa15.9■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 NPY5RQ15761 445 aa15.9■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 PLA2G4DQ86XP0 818 aa15.9■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 BLIDQ8IZY5 108 aa15.9■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 RETREG2Q8NC44 543 aa15.9■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 IL27Q8NEV9 243 aa15.9■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 RASGRP4Q8TDF6 673 aa15.9■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 AIFM3Q96NN9 605 aa15.9■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.147e-7■■■□□ 16.4
GGA3-215ENST00000582821 SDF4Q9BRK5 362 aa15.9■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 SLC9A2Q9UBY0 812 aa15.9■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
GGA3-215ENST00000582821 TET1Q8NFU7 2136 aa15.89■□□□□ 0.13
GGA3-215ENST00000582821 DHX15O43143 795 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
GGA3-215ENST00000582821 ATG7O95352 703 aa15.89■□□□□ 0.13
GGA3-215ENST00000582821 LARGE1O95461 756 aa15.89■□□□□ 0.13
GGA3-215ENST00000582821 FDPSP14324 419 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
GGA3-215ENST00000582821 XBP1P17861 261 aa15.89■□□□□ 0.13
GGA3-215ENST00000582821 RFC2P35250 354 aa15.89■□□□□ 0.13
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