RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581347.2

TMEM200C-202, Transcript of transmembrane protein 200C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene TMEM200C, Length 10,638 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200C-202ENST00000581347 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 PAGE5Q96GU1 130 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 SAT1P21673 171 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 PDE6BP35913 854 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 SMYD2Q9NRG4 433 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 GPC4O75487 556 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 ICA1Q05084 483 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 ITKQ08881 620 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 TMED1Q13445 227 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 ARHGEF25Q86VW2 580 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 ADPGKQ9BRR6 497 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 NFU1Q9UMS0 254 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 NEO1Q92859 1461 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 MED7O43513 233 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 FTCDO95954 541 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 ACTN1P12814 892 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 FAM186BQ8IYM0 893 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 CHD1O14646 1710 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 SPAG7O75391 227 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 TFDP1Q14186 410 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 MYO1CO00159 1063 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 MID2Q9UJV3 735 aa15.94■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 PLA2G4DQ86XP0 818 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 TBX22Q9Y458 520 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 UNC13BO14795 1591 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 GRID2IPA4D2P6 1211 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 CREB3O43889 395 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 CHAMP1Q96JM3 812 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 GLI2P10070 1586 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 BCAMP50895 628 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 ART3Q13508 389 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 RAPH1Q70E73 1250 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 DISC1Q9NRI5 854 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 A1BGP04217 495 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 KCTD6Q8NC69 237 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 CFAP36Q96G28 342 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 TADA3O75528 432 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 CASP2P42575 452 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 KRT80Q6KB66 452 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 ATP6V0A1Q93050 837 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 CCDC127Q96BQ5 260 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 SCINQ9Y6U3 715 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 ZNF521Q96K83 1311 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 GFPT2O94808 682 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 DNAJC24Q6P3W2 148 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 KLC3Q6P597 504 aa15.93■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 RFX7Q2KHR2 1363 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 CCDC188H7C350 402 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 SLCO1A2P46721 670 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 CAV1Q03135 178 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 ESYT2A0FGR8 921 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 TOM1L1O75674 476 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 KSR1Q8IVT5 923 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 KIFC3Q9BVG8 833 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 CLTCL1P53675 1640 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 HINFPQ9BQA5 517 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 COBLO75128 1261 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 CCPG1Q9ULG6 757 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 CENPUQ71F23 418 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 KCNA6P17658 529 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 AS3MTQ9HBK9 375 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 PLCG1P19174 1290 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 POLA2Q14181 598 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 TMEM206Q9H813 350 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 MBD5Q9P267 1494 aa15.92■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 ATP2B4P23634 1241 aa15.91■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 RPS8P62241 208 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 TTLL1O95922 423 aa15.91■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 SLC5A4Q9NY91 659 aa15.91■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 BTDP43251 543 aa15.91■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 ADORA1P30542 326 aa15.91■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 SPARCL1Q14515 664 aa15.91■□□□□ 0.14
TMEM200C-202ENST00000581347 NIM1KQ8IY84 436 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms