RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 NEUROD6Q96NK8 337 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 NOX5Q96PH1 765 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF747Q9BV97 191 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 VPS11Q9H270 941 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 EHMT1Q9H9B1 1298 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 RNF19AQ9NV58 838 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 INVSQ9Y283 1065 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CEP83Q9Y592 693 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CTAGE5O15320 804 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 TLR3O15455 904 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 ZBTB7AO95365 584 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 FGAP02671 866 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 GLI4P10075 376 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 TGFB3P10600 412 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 COL6A1P12109 1028 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 NAT1P18440 290 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 GARTP22102 1010 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 TACR1P25103 407 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 RPL13P26373 211 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 L1CAMP32004 1257 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 DAB2P98082 770 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 UBE4AQ14139 1066 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 SURF1Q15526 300 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 CATIPQ7Z7H3 387 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 LCA5Q86VQ0 697 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 LMNTD2Q8IXW0 634 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM192Q8IY95 271 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 C7orf61Q8IZ16 206 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 SVIPQ8NHG7 77 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 PPM1EQ8WY54 764 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 JDP2Q8WYK2 163 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 PEX11GQ96HA9 241 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 DHRS1Q96LJ7 313 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 PIF1Q9H611 641 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 RETREG1Q9H6L5 497 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 BRMS1Q9HCU9 246 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 PCDH12Q9NPG4 1184 aa3.65□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 STK26Q9P289 416 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 PARP2Q9UGN5 583 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 NUDT5Q9UKK9 219 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 ODF2LQ9ULJ1 636 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 MROH6A6NGR9 719 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 MINDY4BA8MYZ0 360 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 KIF5CO60282 957 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 FAM163BP0C2L3 166 aa3.64□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 CCDC70Q6NSX1 233 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 LIMS2Q7Z4I7 341 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 KRT77Q7Z794 578 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 NETO2Q8NC67 525 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 SLC6A18Q96N87 628 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 PTCHD1Q96NR3 888 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 C22orf23Q9BZE7 217 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 KLC2Q9H0B6 622 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 KCNQ5Q9NR82 932 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa3.63□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 TNFRSF10CO14798 259 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 NPHP1O15259 732 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 PLIN1O60240 522 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 MTA2O94776 668 aa3.63□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 TPM2P07951 284 aa3.63□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 CCDC172P0C7W6 258 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF853P0CG23 659 aa3.63□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 PAX7P23759 505 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 HSD3B2P26439 372 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 THBS2P35442 1172 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 DMTNQ08495 405 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 WASHC5Q12768 1159 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 IFT88Q13099 833 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 NFE2L2Q16236 605 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 C16orf87Q6PH81 154 aa3.63□□□□□ -1.83
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