RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-223ENST00000577256 FPGSQ05932 587 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 MFSD10Q14728 455 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 MFSD5Q6N075 450 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 GPR20Q99678 358 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 HIPK3Q9H422 1215 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 ATP9AO75110 1047 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 CYP3A4P08684 503 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 ME3Q16798 604 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 TMEM199Q8N511 208 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 C7orf31Q8N865 590 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 GTF3C6Q969F1 213 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 NOD1Q9Y239 953 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 MEIS1O00470 390 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 ADAMTS3O15072 1205 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 LGALS2P05162 132 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 GALNT17Q6IS24 598 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 ALG1Q9BT22 464 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 NFASCO94856 1347 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 H3BRB1 525 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 XBP1P17861 261 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 CYP2C18P33260 490 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 SP4Q02446 784 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 PTGISQ16647 500 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 LRIT3Q3SXY7 679 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 NECAB1Q8N987 351 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 WASF1Q92558 559 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 SDF4Q9BRK5 362 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
ATG13-223ENST00000577256 LARGE1O95461 756 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 CTDNEP1O95476 244 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 ARP10275 920 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 CYP2C9P11712 490 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 BLIDQ8IZY5 108 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 SEPT1Q8WYJ6 367 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 AIFM3Q96NN9 605 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 KIF2CQ99661 725 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 FAM86B1E9PN63 330 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 CIITAP33076 1130 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 PLA2G4DQ86XP0 818 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.05■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa20.05■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 PITPNM1O00562 1244 aa20.05■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 CSF2RAP15509 400 aa20.05■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 USP11P51784 963 aa20.05■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 EPHB4P54760 987 aa20.05■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 BFSP2Q13515 415 aa20.05■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 SHHQ15465 462 aa20.05■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 M0R2N6 131 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 CCL23P55773 120 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 RABEP1Q15276 862 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 NPY5RQ15761 445 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 TRIM50Q86XT4 487 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 RETREG2Q8NC44 543 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 IL27Q8NEV9 243 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 CAGE1Q8TC20 777 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 WNT8AQ9H1J5 351 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 IL23AQ9NPF7 189 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 TELO2Q9Y4R8 837 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG13-223ENST00000577256 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms