RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF213O14771 459 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 POTEBQ6S5H4 581 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 RILPL2Q969X0 211 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 C5orf42Q9H799 3197 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC40-211ENST00000574099 CTNNB1P35222 781 aa20.39■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 PGM5Q15124 567 aa20.39■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.39■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.39■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 AMNQ9BXJ7 453 aa20.39■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.39■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 MYO7AQ13402 2215 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 H3BRB1 525 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 LGALS2P05162 132 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 IRS1P35568 1242 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 COL19A1Q14993 1142 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 HFE2Q6ZVN8 426 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 C19orf67A6NJJ6 358 aa20.37■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.37■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.37■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 MUTYHQ9UIF7 546 aa20.37■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 CCND2P30279 289 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 HOXC8P31273 242 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 LTBRP36941 435 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM50Q86XT4 487 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 FIBCD1Q8N539 461 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 SETD4Q9NVD3 440 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 GRM6O15303 877 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 GHRHRQ02643 423 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 HOMER1Q86YM7 354 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 IL17RAQ96F46 866 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF318Q5VUA4 2279 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 MBTPS2O43462 519 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 CAND2O75155 1236 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 SDSP20132 328 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 HYAL1Q12794 435 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 APBB2Q92870 758 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 KCNH6Q9H252 994 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 KLRF2D3W0D1 207 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 ZBTB5O15062 677 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 TBX10O75333 385 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 TGFB3P10600 412 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 ARHGAP4P98171 946 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 LNPKQ9C0E8 428 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 IGFLR1Q9H665 355 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-211ENST00000574099 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 LINC01565O15544 149 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 LINC00271P0C7V0 271 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 POLR2MP0CAP2 368 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 GHRP10912 638 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 GNAT1P11488 350 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 SP4Q02446 784 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 TICAM2Q86XR7 235 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 MTMR8Q96EF0 704 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 PHOX2BQ99453 314 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 TELO2Q9Y4R8 837 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 TRIOO75962 3097 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 C5orf67F2Z3F1 127 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 NCK2O43639 380 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 BMPR1AP36894 532 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 NT5C2P49902 561 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 RNF135Q8IUD6 432 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 GPR20Q99678 358 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 USP26Q9BXU7 913 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 KIAA1671Q9BY89 1806 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC40-211ENST00000574099 KAT6AQ92794 2004 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms